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制備DNA測序模板實(shí)驗(yàn)

時(shí)間:2016-3-22閱讀:159
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制備DNA測序模板實(shí)驗(yàn)

標(biāo)簽: DNA 測序 模板

本實(shí)驗(yàn)包含了用于制備適用于雙脫氧測序的模板及適用于末端標(biāo)記和化學(xué)測序的DNA的實(shí)驗(yàn)方案。所有用于雙脫氧測序的雙鏈模板在與引物退火前必須變性,在一般應(yīng)用上,堿變性在測序中的效果比熱變性好。

  • 制備單鏈M13噬菌體DNA
  • 小量裂解物中制備λ噬菌體DNA
  • 雙脫氧測序的雙鏈質(zhì)粒DNA的堿變性
實(shí)驗(yàn)材料

大腸桿菌

試劑、試劑盒

LBTEM13聚乙二醇容易讓頂層瓊脂乙酸鈉乙醇

儀器、耗材

巴斯德吸管試管離心機(jī)

實(shí)驗(yàn)步驟

1.  如果起始用M13復(fù)制型DNA或M13單鏈DNA,以0.5 ng 重組M13mp復(fù)制型DNA或5~10 ng 單鏈DNA轉(zhuǎn)化40 μl  感受態(tài)大腸桿菌DH5αF'株,按熱休克方案進(jìn)行轉(zhuǎn)化。

2.  轉(zhuǎn)化細(xì)胞加0.2 ml大腸桿菌DH5αF'過夜培養(yǎng)物后,混勻于3 ml H頂層瓊脂,傾倒于37℃平板,倒扣后置于37℃過夜。


3.  大腸桿菌DH5αF'過夜培養(yǎng)物以2×TY培養(yǎng)液稀釋100倍,分裝于18 mm×150 mm 試管,每份1.5 ml。

 

4.  用無菌巴斯吸管挑取M13mp 噬斑,并置于上述每份培養(yǎng)物中,要注意確保瓊脂塊已玻轉(zhuǎn)移。

5.  重復(fù)進(jìn)行挑斑,在37℃生長細(xì)菌5~6  h。

6.  細(xì)菌培養(yǎng)物移至1.5 ml 微量離心管中,于4℃或室溫高速離心5 min,上清移至一個(gè)干凈的1.5 ml 微量離心管中。


7.  噬菌體上清加入200 μl M13 PEG溶液,混勻,于室溫放置15 min,高速離心5 min,棄上清。

8.  高速離心30 s,并以頭部已拉細(xì)的巴斯德吸管吸出殘余液體。

9.  以100 μl TE重懸沉淀,加入100 μl 緩沖液平衡酚,旋渦混合器輕輕振蕩15~20 s。

10.  于4℃或室溫高速離心5 min,轉(zhuǎn)移上上清水相于一個(gè)干凈的微量離心管中。

11.  加入11 μl 3 mol/l pH5.2的乙酸鈉和250 μl *乙醇,于-70℃冷凍20 min。

12.  4℃高速離心10 min,棄上清。

13.  加入100 μl 冰冷70%乙醇,微量離心,棄上清,重復(fù)此70%乙醇冼滌1次。

14.  在Speedvac真空旋轉(zhuǎn)蒸犮器中干燥沉淀。

15.  沉淀重溶于20 μl 緩沖液,取0.5 μl 在小型凝膠中電泳,以確證DNA的濃度。

16.  剩余貯于-20℃直到用作模板進(jìn)行測序反應(yīng)。

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