美國俄亥俄州哥倫布(COLUMBUS, Ohio)消息，科學家通過對突變檢測方法的比較研究發(fā)現(xiàn)，人們以前可能低估了存在于乳腺與卵巢腫瘤易感患者身上的關鍵基因突變數(shù)量。這個突變研究新發(fā)現(xiàn)對臨床腫瘤遺傳學家和他們的患者都具有深遠的意義。

這項研究發(fā)表于2001年12月11日的醫(yī)學遺傳學雜志(Journal of Medical Genetics)上。他們用四種不同的方法去比較兩類與乳腺和卵巢腫瘤發(fā)生強相關性的長片段基因：BRCA1和BRCA2，來確定哪一種方法能夠zui有效的發(fā)現(xiàn)存在于基因上的突變。他們希望發(fā)現(xiàn)用以上四種突變檢測技術，能夠為遺傳流行病學建立一個客觀的檢測依據(jù)。

科學家以前的研究顯示在BRCA1和BRCA2兩個基因都存在突變的婦女中，有56-87 %的人會患乳腺癌，有27-44%的人會患卵巢癌。而流行病學的研究則顯示，只有不到5%的乳腺癌患者會帶有這兩種突變。

zui近一項由俄亥俄州立大學臨床癌癥遺傳學計劃主席Charis Eng博士和猶他州鹽湖城Myriad遺傳學實驗室Tom S. Frank博士領導的研究顯示，后者的數(shù)據(jù)明顯偏低，這可能是由于遺傳突變篩選的方法造成的。

Eng說，對突變zui直接的遺傳學檢測就是對DNA片段進行直接測序，但這種方法過于昂貴，而且極為耗費勞動力。因此很多實驗室在進行BRCA1 和BRCA2基因的流行病學研究時，都選擇了一些快捷而便宜的篩選方法。

在乳腺癌信息中心(Breast Cancer Information Core)的贊助下，他們就目前的一些篩選方法與基因測序方法進行了比較。收集了65份樣品，其中58個含有BRCA1的突變。然后將這些樣品送往四個試驗室，分別采用不同的篩選方法對樣品進行檢測。這四個實驗室是：美國德克薩斯大學醫(yī)療研究中心(University of Texas Health Science Center) Jan Vijg 博士的實驗室，西雅圖Fred Hutchinson 癌癥研究中心Elaine Ostrander 博士的實驗室，荷蘭雷登大學(the University of Leiden)的實驗室和奧地利維也納大學Teresa Wagner博士的實驗室。 他們各自采用的方法分別是：SSCP (DNA單鏈構象多態(tài)性分析)、CSGE (構象敏感凝膠電泳)、TDGS (二維基因掃描技術)和DHPLC (變性DNA 液相層析技術)。

結果只有采用DHPLC法的實驗室檢測出了先前用測序方法確定的所有的突變。

采用TDGS法的實驗室只正確地鑒定了91%的突變。采用SSCP和CSGE法的實驗室則分別正確鑒定了72%和76%的突變，它們的堿基替換鑒定率更低，分別為65%和60%。SSCP 和CSGE法有超過20%的突變根本就沒有鑒別出來。

Eng說，這種檢測的失誤，既有人為的原因，也由于方法本身存在缺陷的原因。這種檢測失誤造成人們以前對BRCA1的突變實際是低估了。

例如，以前的一項研究用SSCP法發(fā)現(xiàn)BRCA1的突變率為3.3%，現(xiàn)在看來實際突變率可能要接近5%。還有一項臨床遺傳風險研究用CSGE法對腫瘤患者的BRCA1進行突變檢測，稱檢測到16%的突變，現(xiàn)在看實際突變率可能要接近27%。

臨床腫瘤學家要用這些流行病學實驗數(shù)據(jù)向其患者提供咨詢意見并進行治療管理，因此必須使這些數(shù)據(jù)盡量可靠。

這項研究對有腫瘤家族史的婦女有著更大的意義，以前用SSCP和CSGE方法對 BRCA1和BRCA2 基因所作的遺傳學檢測有可能遺漏重要的突變，這會使他們放松對癌癥的警惕，以致不能早期發(fā)現(xiàn)與治療。

科學家也就除直接測序以外的其它方法的檢測費用進行了比較，結果檢測效果的DHPLC法，檢測費用也zui高。他們認為隨著技術的提高，各種方法的檢測效率會相應的提高，檢測費用則會越降越低。

這項研究還得到美國國立衛(wèi)生研究院(the National Institutes of Health ), 荷蘭癌癥協(xié)會(the Dutch Cancer Society )和 Ludwig-Boltzmann Institut fuer Experimenle Onkologie的資助。

本項研究的部分研究人員來自Myriad遺傳實驗室，他們負責對樣品的BRCA1和BRCA2基因商業(yè)測序。