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時(shí)間:2013-7-26閱讀:945
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篩選之前確定G418濃度:

1.  由于每種細(xì)胞對(duì)G418的敏感性不同,而且不同的廠家生產(chǎn)的G418有效成分的比重不同,一般1 g 的粉劑中有效的G418含量大約為0.722 g。
2.  G418是*的類似物,兩者都是通過抑制核糖體的功能和蛋白質(zhì)的合成而殺死細(xì)胞的。但是*對(duì)真核細(xì)胞無作用而G418對(duì)細(xì)菌和真核細(xì)胞都起作用。neo就是編碼3‘磷酸轉(zhuǎn)移酶的基因,它表達(dá)的蛋白能夠分解*和G418。在進(jìn)行轉(zhuǎn)染時(shí)細(xì)胞膜受到影響,抗生素可能對(duì)細(xì)胞產(chǎn)生較大影響,加上G418有殺菌作用,所以有人主張轉(zhuǎn)轉(zhuǎn)染時(shí)不加其它抗生素。
3.  匯合度對(duì)G418篩選結(jié)果的影響很大,一般篩選時(shí)匯合度不宜超過50%
4.  G418的活性不盡相同,所以在篩選之前,一定要確定G418的*篩選濃度。具體如下:將細(xì)胞稀釋到1000個(gè)細(xì)胞/ml,在100 ug/ml~1 mg/ml 的G418濃度范圍內(nèi)進(jìn)行篩選,選擇出在10~14天內(nèi)使細(xì)胞全部死亡的zui低G418濃度來進(jìn)行下一步的篩選試驗(yàn)。一個(gè)具體試驗(yàn):3×106個(gè)細(xì)胞電轉(zhuǎn)后,分別接種1/4000,1/1000,1/300細(xì)胞到24孔板中,48h后加藥篩選,此時(shí)1/300細(xì)胞孔內(nèi)大約50%匯合度。理論上1/4000孔內(nèi)應(yīng)有4%的匯合度。篩選9天后,觀察1/4000孔內(nèi)有兩三個(gè)克隆,按比例1/300孔內(nèi)應(yīng)該有幾十個(gè)克隆,事實(shí)上,它們幾乎全死光了,只有幾個(gè)克隆。
 
加藥時(shí)間和維持濃度
1.  由于基因轉(zhuǎn)染到細(xì)胞內(nèi)之后要一段時(shí)間才能表達(dá)出蛋白質(zhì)。所以篩選不能太早;但是也不能太晚,因?yàn)檗D(zhuǎn)染了外源基因的細(xì)胞代謝負(fù)荷較大,增值較慢,時(shí)間長了就會(huì)被沒有外源基因轉(zhuǎn)入的細(xì)胞所淹沒,zui終導(dǎo)致篩選不出陽性,一般要在轉(zhuǎn)染24小時(shí)之后才開始加G418篩選。隨著細(xì)胞的代謝G418的濃度和活性都回下降,所以每3~5天都要更換一次含有G418的篩選液。這時(shí)藥物濃度可以降至200 ug/ml。
2.  加抗生素的時(shí)機(jī),主要是考慮插入到細(xì)胞基因組的抗性基因是否已經(jīng)得到表達(dá)。一般是轉(zhuǎn)染48小時(shí)后加入抗生素。挑出單后就可以用維持濃度,一般是篩選濃度的1/2。
關(guān)于維持濃度,有人說細(xì)胞會(huì)出現(xiàn)對(duì)抗生素的抗性,應(yīng)不斷提高其濃度。而且,如果你要挑選到幾個(gè)陽性克隆中較高表達(dá)的的話,可以調(diào)整抗生素的濃度。當(dāng)然,抗性基因高表達(dá),目的基因不一定就跟著高表達(dá)。
 
篩選時(shí)的培養(yǎng)液
加藥篩選約6天左右,細(xì)胞會(huì)大量死亡,孔中只剩下的細(xì)胞。這時(shí)會(huì)出現(xiàn)兩個(gè)問題:
1.   死亡的細(xì)胞會(huì)裂解釋放出有害物質(zhì),導(dǎo)致那些有neo表達(dá)的陽性細(xì)胞死亡,即非選擇性死亡,因此要及時(shí)換液
2 .  孔中細(xì)胞數(shù)目很少,細(xì)胞之間的信號(hào)會(huì)變得很弱,也會(huì)導(dǎo)致陽性細(xì)胞的狀態(tài)不佳甚至死亡。這個(gè)時(shí)候需要一種特殊的培養(yǎng)液:假如你要轉(zhuǎn)染3T3細(xì)胞,在3T3細(xì)胞匯合度達(dá)到80%的時(shí)候,換液,培養(yǎng)過夜之后收集培養(yǎng)液,通過濾器消毒,和新鮮的培養(yǎng)液按1:1混合備用。再轉(zhuǎn)染后篩選過程中就可以應(yīng)用這種培養(yǎng)基。
3.  適當(dāng)增加血清濃度。
 
篩選時(shí)出現(xiàn)的問題及其解決辦法:
1.  問題1。做hela細(xì)胞的篩選,現(xiàn)在已經(jīng)篩選3周,在6孔板中已經(jīng)長出一些細(xì)胞簇,想把它挑到96孔板中,就用2 ul *消化,在消化過程中,*擴(kuò)散,細(xì)胞已經(jīng)四散開,和周圍的其它細(xì)胞簇融合在一起(我的細(xì)胞簇離的很近),就是說幾個(gè)細(xì)胞簇被*融合在一起,那樣根本沒有辦法做下去了,該怎么辦?
(1)可以減少*量;*在加入之前要用37度溫箱預(yù)熱,并且PBS潤洗細(xì)胞層,以減少可能殘存的血清的影響;
(2)加入*后,稍過幾秒鐘就可以吸走消化液了,不用吸干凈,然后放到37度溫箱中繼續(xù)作用1 min,這時(shí),消化酶可以繼續(xù)作用的,又可避免*擴(kuò)散;
(3)顯微鏡下觀察細(xì)胞*松散開,就可以在你感興趣的局部加培養(yǎng)基,并吸走你的可隆了呀
(4)具體消化的時(shí)間,你注意摸索一下,如果在步驟2中顯微鏡下見細(xì)胞尚未*松散開,可以再重復(fù)的,直到松散開,能夠被吸走為止。
我的建議:1.  在100 mm dish中挑克隆,細(xì)胞分的稀一點(diǎn)。2.  把細(xì)胞全部消化下來,在96孔板中逐步稀釋獲得單
2.  問題2。篩選成功的概率:只要有抗性加壓篩選,挑選到的機(jī)率還是比較大的。一般能挑到穩(wěn)定表達(dá)的概率我認(rèn)為大概有70~80%,但是想挑到表達(dá)量高且能穩(wěn)定表達(dá)的,不大容易。這個(gè)可能是在染色體上,合適的整合位點(diǎn)太少的緣故。
3.  問題3。細(xì)胞形態(tài)的改變:穩(wěn)定轉(zhuǎn)染后陽性均出現(xiàn)不同程度的細(xì)胞形態(tài)的改變。
想請(qǐng)教各位有經(jīng)驗(yàn)的高手,你們做穩(wěn)定轉(zhuǎn)染時(shí)有此發(fā)現(xiàn)嗎?我的也是,而且好象還有好幾種不同類型的細(xì)胞。不過,我轉(zhuǎn)的是一種抑癌基因。
4.  問題4。單克隆化的時(shí)機(jī)和個(gè)數(shù):加藥篩選時(shí), 一般等到確認(rèn)的轉(zhuǎn)染細(xì)胞長到70%以上時(shí),再做有限稀釋法,以克隆出陽性細(xì)胞,同時(shí)要保持適當(dāng)?shù)乃幬餄舛?,以防突變和污染。若?xì)胞長好了,如有40%以上,就可以有限稀釋了一般,篩選5,6個(gè)克隆就有需要的,但保險(xiǎn)起見,篩10個(gè)吧。
5.  從單化時(shí)開始,就要加大營養(yǎng),清和生長因子。
 
單化的操作方法:
1.  方法1。單克隆細(xì)胞的培養(yǎng)就是這樣的,我現(xiàn)在作了15個(gè)96孔板的單克隆,總共才得到大約50株單克隆在做時(shí)候應(yīng)保證每個(gè)孔中的細(xì)胞是一個(gè),因此,我一般在200毫升的培養(yǎng)液中加入小于96個(gè)的細(xì)胞,這樣平均到每個(gè)孔中因該可以由滿意的結(jié)果你所說的現(xiàn)象我也遇到過,我也百思不得其解,只好做多一點(diǎn)的96孔板來補(bǔ)充。培養(yǎng)SPC-A1(人肺癌細(xì)胞),轉(zhuǎn)染了EGFP,然后進(jìn)行了G418抗性篩選和96孔板單篩選,zui終獲得了成功將我的實(shí)驗(yàn)步驟寫出來,希望對(duì)你有所幫助。
2.  方法2。實(shí)驗(yàn)步驟大致為:預(yù)先對(duì)96孔板除*排之外的所有孔加含15%胎牛血清的細(xì)胞培養(yǎng)液,0.1 ml/孔,并放于細(xì)胞培養(yǎng)箱中溫育,然后*消化穩(wěn)定表達(dá)GFP的細(xì)胞,細(xì)胞液稀釋至密度為1000 cell/ml 的單細(xì)胞懸浮液,上述細(xì)胞液接種于96孔板的*排,0.2 ml/孔,從中吸取0.1 ml 細(xì)胞溶液接種于第二排,混合后,從第二排中吸取0.1 ml 接種于第三排……,一直到第八排,zui后一排都丟棄0.1 ml 細(xì)胞液。一般來說,每一列都會(huì)有某個(gè)孔中只有1~2個(gè)細(xì)胞。
3.  方法3。我的改進(jìn)之處:我在顯微鏡下觀察,標(biāo)記孔中小于10個(gè)細(xì)胞的孔,然后在顯微鏡下用記號(hào)筆在皿底把單個(gè)熒光細(xì)胞圈住,然后在操凈臺(tái)里用滅過菌底牙簽將圈外的細(xì)胞戳死,這樣留在孔中的就是單克隆了,通過這樣的,我一共獲得了6株單。但需注意的是:時(shí)間不能超過30min,否則細(xì)胞極容易死亡。解決操作時(shí)間長的方法:拿一個(gè)96板,在里面隨便種一些細(xì)胞,然后用牙簽練習(xí),我練了5~6次后非常熟練了
培養(yǎng)液:是含15%的胎牛血清,加大營養(yǎng),有利于細(xì)胞生長;另外一種方法是對(duì)還沒有變黃的細(xì)胞液進(jìn)行過濾,過濾后的培養(yǎng)含有很多生長因子,可以作為單的培養(yǎng)液。
4.  方法4。我曾經(jīng)幫同事做過挑單克隆,直接將倒置顯微鏡搬到操凈臺(tái)內(nèi)紫外照射30分鐘,然后先在顯微鏡下把要挑的單克隆初看一遍,算一下大概要挑幾個(gè),然后在96孔板內(nèi)先加好培養(yǎng)基,再將6孔板內(nèi)的培養(yǎng)基吸出,加入少量的*,大概能蓋住板底即可,然后在顯微鏡下觀察細(xì)胞狀態(tài),在有些變圓時(shí),即用10ul槍在顯微鏡下直接吸克隆,放入事先準(zhǔn)備好的加了培養(yǎng)基的96孔板內(nèi),先吸大的克隆,在**起到作用使細(xì)胞松散擴(kuò)散開了時(shí),已經(jīng)吸了將近十個(gè)克隆了,動(dòng)作快一些時(shí)能吸十幾個(gè),我做過幾次了效果很好,沒有出現(xiàn)污染。(在要進(jìn)行操作時(shí),用酒精將手好好擦擦,將顯微鏡用新潔爾滅也擦一下,一般不會(huì)有什么問題),你可以試試,只要小心一些就行了。
5.  方法5。關(guān)于穩(wěn)轉(zhuǎn)的方法,好像園子里很多xdjm都用的是有限稀釋法來作,但是我們實(shí)驗(yàn)室基本上都不用九十六孔做有限稀釋來作單的,一般的做法都是這樣:
(1)3.5 cm 皿鋪細(xì)胞,長到大概80%以上的時(shí)候作轉(zhuǎn)染。
(2)轉(zhuǎn)染后一天消化,傳到一個(gè)大皿(1:6)或者兩個(gè)大皿(1:12)。
(3)再過一天后加入帶G418的培養(yǎng)基。
(4)依據(jù)細(xì)胞不同,大概從加入G418的第三天到第八天之間細(xì)胞開始出現(xiàn)大量死亡,活下來的細(xì)胞就形成單。
(5)單長到相對(duì)較大的集落后,于顯微鏡下用200 ul 槍挑取細(xì)胞集落,一般挑上48個(gè),種在兩塊24孔板上。
(6)于24孔板上繼續(xù)培養(yǎng),約4、5天后即可消化傳代,取部分作收蛋白western之用,根據(jù)western結(jié)果確定真陽性。
 
單化后細(xì)胞特點(diǎn)和處理:
1.  單后細(xì)胞生活習(xí)性改變:考慮質(zhì)粒的表達(dá)對(duì)細(xì)胞的生長有一定的影響,查文獻(xiàn)確認(rèn)一下。
2.  單后的培養(yǎng)需要多加些血清,再傳代時(shí)保證板子不影響細(xì)胞貼壁,避免出現(xiàn)傳代后細(xì)胞浮起來后死亡的現(xiàn)象。
3.  篩選成單后,不加藥培養(yǎng)2代,再加藥繼續(xù)篩選兩代,此時(shí)如果不出現(xiàn)死亡細(xì)胞則可以認(rèn)為是穩(wěn)定細(xì)胞系。復(fù)蘇后加G418傳代2次,然后按部就班。
4.  過一段時(shí)間再篩選時(shí),G418的濃度有人認(rèn)為需要比穩(wěn)轉(zhuǎn)時(shí)小寫,此外,加藥后對(duì)蛋白質(zhì)的表達(dá),細(xì)胞形態(tài)有影響,因此做功能時(shí)要停藥培養(yǎng)合適時(shí)間后再做。
5.  穩(wěn)轉(zhuǎn)PA317細(xì)胞后再此篩選(需要隔一段時(shí)間再加壓篩一次),細(xì)胞也是死的厲害,不過還是可以篩到,不過需要用合適的濃度??梢栽诩?xì)胞傳幾代后,分出一小部分,不加G418培養(yǎng)一段時(shí)間,然后再加你維持細(xì)胞的抗性的G418濃度培養(yǎng)一天看細(xì)胞會(huì)不會(huì)死亡,如果死亡,說明外源基因還沒有丟失。
6.  有人這樣做的:轉(zhuǎn)染加藥一段時(shí)間后,板子上出現(xiàn)了幾個(gè)克隆,如果有幾十個(gè)克隆,然后挑其中七八個(gè)到24孔板里繼續(xù)加藥篩選,等24孔長滿后再轉(zhuǎn)到6孔板繼續(xù)加藥篩選,6孔板里長差不多滿后,每孔消化下來大概一半做WB鑒定目的基因表達(dá),剩一半留著繼續(xù)加藥培養(yǎng),等WB結(jié)果出來有陽性的孔就保留下來,陰性的丟掉。
 
單化后鑒定:
1.  穩(wěn)定轉(zhuǎn)染細(xì)胞,通過PCR鑒定,發(fā)現(xiàn)目的基因并不上調(diào),瞬時(shí)轉(zhuǎn)染表達(dá)是增高的。原因:瞬轉(zhuǎn)是在強(qiáng)啟動(dòng)子下,穩(wěn)轉(zhuǎn)時(shí)你得到的細(xì)胞株可能失去了此啟動(dòng)子,或者是改變了細(xì)胞的生理特性!用WB和瞬轉(zhuǎn)對(duì)照鑒定一下!
2.  轉(zhuǎn)染后質(zhì)粒整合到基因組是隨機(jī)的,一般兩月后(傳代10代以上)還表達(dá)你想要蛋白的單可以認(rèn)為是整合了質(zhì)粒的。

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