與rRNA和tRNA不同的是,哺乳動物細胞的絕大部分mRNA在其3"端均有一poly(A)尾,因此可以用oligo(dT)-纖維素親和層析法從大量的細胞RNA中分離mRNAdmonds等,1971;At Leder,1972)。在構(gòu)建cdna文庫時, 必須經(jīng)上述純化步驟制備mRNA模板。
進行Northern雜交或Sl 核酸酶作用圖分析時,與總RNA相比,采用poly(A)+ RNA能獲得更為滿意的結(jié)果。 可以按照Gilham(1964)所述方法制備oligo(dT)-纖維素,也可以買現(xiàn)成的產(chǎn)品。
1)用0.1mol/L NaOH懸浮0.5-1.0g 0ligo(dT)-纖維素。
2)將懸浮液裝入滅菌的一次性層析柱或裝入填有經(jīng)用DEPC處理并經(jīng)高壓滅菌的玻璃棉的巴期德吸管中, 柱床體積為0.5-1.0ml,用3倍柱床體積滅菌水沖洗柱床。柱床體積為1m的oligo(dT)-纖維素zui大量為10mg總RNA,如果總RNA的量較少,則應(yīng)減少oligo(dT)-纖維素的使用量以防止poly(A)+RNA在過柱以及后續(xù)步驟中損失。
3)用無菌的1x層析柱加樣緩沖液沖洗柱床直至流出液的pH值小于8.0。1x層析柱加樣緩沖液
20mmol/L Tris.Cl(pH7.6)
0.5mol/L NaCl
1mmol/L EDTA(pH8.0)
0.1%SDS
可按以下方法制備滅菌的層析柱加樣緩沖液;將適量無rna酶的Tris. Cl(pH7.6)、氯化鈉和EDTA貯存液(參見344頁)混合在15lbf/in2(1.034x105Pa)高壓下蒸氣滅菌,待其次序卻至65℃左右時加入已在65℃預(yù)熱30分鐘的10 %SDS貯存液。也可以用0.05mol/L檸檬酸鈉代替Tris.Cl 然后用DEPC處理檸檬鈉-NaCL-EDTA和SDS的混合溶液。
4)用滅菌水溶解RNA,于65℃溫育5分鐘后使迅速冷卻至室溫,加等體積的2x層析柱加樣緩沖液,上樣,立即用滅菌的試管收集洗液。 當(dāng)所的RNA溶液均進入柱床后,加1倍體積的1x層析柱加樣 ,繼續(xù)收集洗出液。加熱RNA可以破壞可能涉及poly(A)尾的二級結(jié)構(gòu)。
5)當(dāng)全部溶液流出后,將收集液置于65℃溫育5分鐘,重新上樣,并收集流出液。