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上海士鋒生物關于鑒定內質網(wǎng)跨膜蛋白拓撲結構的介紹

時間:2013/6/2閱讀:817
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4月18日,PLoS One在線發(fā)表了中科院上海生命科學研究院生化與細胞所胡紅雨課題組的研究論文。該論文應用氧化還原敏感的Gaussia熒光素酶和綠色熒光蛋白GFP,報告融合蛋白所處的不同氧化還原環(huán)境,從而鑒定目標蛋白質在細胞內的亞定位及其拓撲結構。

真核細胞中約有三分之一的蛋白質進入內質網(wǎng)進行折疊、修飾、膜整合、轉運和分泌,內質網(wǎng)內和跨膜蛋白在這些過程中發(fā)揮著重要的功能。但是,由于跨膜蛋白疏水區(qū)域與膜脂結合的復雜性,以及內質網(wǎng)蛋白質的動態(tài)性,現(xiàn)有的鑒定內質網(wǎng)蛋白的定位和跨膜拓撲結構的方法非常有限,且存在操作技術繁瑣等問題。

Gaussia熒光素酶(Gluc)是近年報道的分子量zui小、活性很高的熒光素酶,含有五對二硫鍵,需要在內質網(wǎng)的氧化環(huán)境中才具有*的發(fā)光活性。博士生李海音等利用Gluc的發(fā)光活性對氧化還原敏感的特性,將Gluc與GFP串聯(lián)表達作為新的報告基因,融合于內質網(wǎng)跨膜蛋白的不同位點,并在HEK 293T細胞中表達。他們以Gluc的發(fā)光活性檢測融合位點的氧化還原環(huán)境,而用GFP的熒光強度檢測融合蛋白的表達量,從而報告不同融合位點的相對氧化還原環(huán)境。

該方法可用于區(qū)分其定位于內質網(wǎng)或者細胞質,以此鑒定內質網(wǎng)蛋白的定位和拓撲結構,已成功應用于單次跨膜蛋白(如calnexin、Sec61g 和CD3δ)和多次跨膜蛋白(如Herp和HRD1)的拓撲結構。該方法靈敏度高、簡單快速,使內質網(wǎng)蛋白拓撲結構的高通量鑒定成為可能。同時,也可進一步應用于鑒定細胞膜蛋白的拓撲結構,以及檢測蛋白質分泌途徑中的氧化還原環(huán)境變化,將為研究蛋白質在內質網(wǎng)中的定位、折疊、氧化還原和修飾,以及動態(tài)的膜整合、轉運和分泌提供更加適用、方便和的生化和細胞分析技術。

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