液相色譜柱是色譜分析過程中重要的部分，相當于人體的“心臟”。根據(jù)自己要分析的樣品去選擇合適的液相色譜柱，需要考慮不同參數(shù)將會造成什么影響，比如粒徑、酸堿性、極性和分子量大小等。
液相色譜柱在色譜儀分析系統(tǒng)中起著分離作用，是色譜分析的核心部件。正確使用和維護色譜柱尤為重要，使用不當就會降低柱效、縮短使用壽命甚至損壞。溫度的突然變化或者使色譜柱從高處掉下都會影響柱內的填充狀況；柱壓的突然升高或降低也會沖動柱內填料，因此在調節(jié)流速時應該緩慢進行，以保持色譜柱內填料的穩(wěn)定性。
即使是液相色譜柱也分很多類型，比如正相、反相、C18柱、親水性色譜柱等等。只有了解影響分析柱性能的因素，才能結合目標分析物的性質、需要達到的分析效果及實驗室條件來選擇適合的色譜柱。
現(xiàn)代液相色譜分析中，色譜柱的選擇直接影響了分離效果的好壞，選擇合適的色譜柱可以縮短方法開發(fā)所需的時間，并且使方法更具穩(wěn)定性。硅膠基質：通用的基質，強度大，化學修飾容易，但使用的pH值范圍有限（一般為2—8，特殊修飾的可以達到1—12）。
聚合物基質：多為聚苯乙烯—二乙烯基苯或聚甲基丙烯酸脂，化學穩(wěn)定，應用pH范圍寬，具有更強的疏水性，對蛋白質等樣品分離效果較好；但強度較小，有機溶劑可能導致聚合物溶脹而受損，批次重復性較差，商品化色譜柱不多，一般價格較貴。載碳量：基質表面鍵合相的比例，載碳量高，則保留增加，適合分析非極性化合物。
