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小鼠elisa試劑盒表達(dá)基因克隆技術(shù)的新進(jìn)展

2017-7-25  閱讀(220)

小鼠elisa試劑盒現(xiàn)代分子生物學(xué)研究表明,人類基因組約由10萬左右的不同基因組成,這些基因選擇性的表達(dá)決定了機體整個生命過程,基因表達(dá)的變化處于控制生物學(xué)調(diào)節(jié)機制的中心位置。因此,分離并克隆差異表達(dá)基因不僅有助于闡明生命的粵秘,而且還能為基因診斷與治療提供重要的理論依據(jù)。近幾年來,差異表達(dá)基因克隆技術(shù)不斷完善與發(fā)展,已成為研究腫瘤和疾病等相關(guān)基因的重要手段。
 
一、mRNA差異展示
 
mRNA差異展示(mRNA differential display,DDRT-PCR)是目前篩選差異表達(dá)基因zui有效的方法之一,其基本原理是:3´端采用錨定引物,與mRNA3´poly a結(jié)合,進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,形成mRNA:cDNA雜交分子,5´端采用20條隨機引物,與錨定引物一起進(jìn)行PCR擴增,其產(chǎn)物經(jīng)測序膠顯示出來,再回收鑒定克隆差異條帶。1992年Liang和Pardee[1]建立此技術(shù)時,5´端采用20條隨機引物,每條由10個堿基組成,3´端采用12條引物即T12MN(M=A、C或G,N=A、G、C、T)。這種組合從統(tǒng)計學(xué)上幾乎能*覆蓋所有的mRNA序列,差異表達(dá)的基因會全部呈現(xiàn)出來。實踐證明,這種方法有效,但假陽性率在50%~70%左右,差異條帶在Northern印跡上重現(xiàn)性差,后續(xù)處理也比較復(fù)雜。1994年Ito[2]等對3´端引物進(jìn)行了改進(jìn),把12條引物改為3條,即T12A、T12C、T12G,使得實驗操作簡化。1995年Ayala[3]等提出了在3´端錨定引物與5´端隨機引物上皆增加10個堿基,使得上下游引物Tm值在60℃左右,PCR循環(huán)參數(shù)也改為前5個循環(huán)采用Liang和Pardee的參數(shù),即94℃30s,40℃2min,72℃30s。經(jīng)這樣改進(jìn),顯著地增強了差異條帶的重復(fù)性和敏感性,同時使得差異條逼帶的克隆十分方便。1996年4月,Liang和Pardee[4]對5´端此物進(jìn)行了改進(jìn),引物條數(shù)改為8條,皆帶上HindⅢ酶切位點,每條由13個堿基組成,3´端錨定引物采用3條,也帶上HindⅢ酶切位點,每條由18個堿基組成,PCR循環(huán)條件仍采用94℃30s,40℃2min,72℃30s,40個循環(huán),zui后在72℃延伸7min。1998年[5]我們在Liang和Pardee改進(jìn)的基礎(chǔ)上,對PCR循環(huán)參數(shù)進(jìn)行了改進(jìn),即前5個循環(huán)采用94℃30s,40℃2min,72℃30s,后35個循環(huán)采用94℃30s,55℃2min,72℃30s,zui后在72℃延伸7min。經(jīng)這樣改進(jìn),既保持了擴增效率,又增強了差異條帶的特異性及重復(fù)性,降低了假陽性率。
 
總之,mRNA差異展示具有簡便、快速、所需起始材料少、同時可在多個材料之間或不同處理材料之間進(jìn)行比較等優(yōu)點,但具有較高頻率的假陽性和短小的差異片段的缺點,給后續(xù)處理帶來一系列問題,雖然此技術(shù)經(jīng)過了一些起改進(jìn),但這兩個缺點仍限制著此方法的充分應(yīng)用。
 
二、小鼠elisa試劑盒代表性差示分析
 
代表性差示分析(representational difference analysis,RDA)zui早由Lisitsyn等提出的。1994年,Hubank和Schatz[6]將其應(yīng)用于克隆差異表達(dá)基因,其基本原理是:靶方(Tester,T)和驅(qū)動方(Driver,D)的cDNA在進(jìn)行差方式分析前均用一種識別4堿基序列的限制酶作切割處理,形成平均長度為256bp的cDNA片段代表群,*次T與D雜交反應(yīng)時,兩者總量比為1:100,第二次增加到1:400,第三次增加到1:8000,再利用PCR以指數(shù)形式擴增雙鏈模板,而僅以線性形式擴增單鏈模板這一特性,通過降低cDNA群體復(fù)雜度和多次更換cDNA兩端接頭,來特異擴增目的基因片段。特別是T減D雜交反應(yīng)后僅設(shè)置了72℃復(fù)性與延伸及95℃變性這兩個循環(huán)參數(shù),共20個循環(huán),從而使PCR產(chǎn)物特異性大大提高。此技術(shù)zui大的優(yōu)勢是差異條帶在Northern印跡上重現(xiàn)性好,假陽性少。缺點是所需起始材料較多,更多信賴于PCR技術(shù),T與D之間若存在較多差異,或T中存在某些基因上調(diào)表達(dá),則難達(dá)到預(yù)期目的,而且工作量比DDRT-PCR大,周期長。
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