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新研究長類動物中的一種抗病毒蛋白可以引發(fā)基因突變的激增

時間:2016/4/18閱讀:247
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根據(jù)研究表明,存在于人類和其他靈長類動物中的一種抗病毒蛋白可以引發(fā)基因突變的激增,這會加速物種的進化。
加利福尼亞州,帕羅奧圖市斯坦福大學(xué)的遺傳學(xué)家Kelley Harris說:“在我的認知當中,這很可怕。”她并沒有涉及這項工作。她說,偶然的基因突變往往是有害的,但凡事皆有例外,這些突變也可以為進化提供原材料,同時這可以使被病毒包圍的基體產(chǎn)生更好的抗病毒防御。這些研究并不能證明當人體感染病毒會有益于人類改變自身的DNA,但這是極有可能的。
有史以來,病毒都是將它們的基因載體插入宿主的染色體中,欺騙宿主細胞分裂來產(chǎn)生更多病毒?,F(xiàn)如今,我們的染色體中隱藏著這些外來基因片段,將之稱為逆轉(zhuǎn)錄酶病毒或者轉(zhuǎn)位因子,但是許多只是現(xiàn)在存在,并不能自己復(fù)制特定的基因片段。這是因為我們的基體中存在一類可以改變這段DNA的蛋白質(zhì)。這些叫做胞嘧啶脫氨酶的蛋白質(zhì)可以在DNA的病源基因中找到特定的組成DNA的分子對(叫做堿基對),使胞嘧啶堿基化學(xué)性轉(zhuǎn)變成尿嘧啶――從C到U分子上的基因突變可以破壞一個基因。
在2012年,學(xué)者們發(fā)現(xiàn)特定的胞嘧啶脫氨酶蛋白在一些癌細胞中起著同樣的作用??的螤柎髮W(xué)的統(tǒng)計生物學(xué)家Alon Keinan說:“你可以發(fā)現(xiàn)它們極其活躍地作用在腫瘤細胞的DNA上,這會造成許多突變,可能會促進細胞的無限增殖。”因為這些癌細胞是肺、腎、或其它器官的一部分,基因突變只會作用在這些器官組織。但是如果這種胞嘧啶脫氨酶活躍在這些將形成卵子或精子的生殖系細胞中,基因突變將會影響后代,并zui終改變物種進化的歷程(軌跡)。
為了證明是否是特定的胞嘧啶脫氨酶(APOBEC3G)造成的基因突變,以色列,拉瑪特甘,希伯來大學(xué)的統(tǒng)計生物學(xué)家了Keinan,Keinan的團隊專門從事通過基因組比對來了解基因突變模式(規(guī)律)的實驗。Keinan團隊比對了現(xiàn)代人、丹尼索瓦人、尼安德特人、及黑猩猩基因組與老鼠、獼猴、猩猩的基因組,發(fā)現(xiàn)了現(xiàn)代人類與黑猩猩基因組上由胞嘧啶替換成其它堿基的不同尋常的集中變化。他們注意到只含有APOBEC3Gzui易作用的目標序列的DNA片段才會發(fā)生突變。例如,含有3個胞嘧啶連續(xù)排列的DNA片段就是一種APOBEC3G的目標序列,APOBEC3G蛋白往往會使基因序列中第三個胞嘧啶被另外的堿基取代。
歸總起來,研究者們發(fā)現(xiàn),在人類和黑猩猩10000個群體中大概有37000個突變發(fā)生,他們認為這些突變是由他們在基因研究一文中提到的蛋白質(zhì)造成的。在猩猩、獼猴和老鼠中的突變因子是胞嘧啶,但在另外四個物種的突變則是另外的堿基。許多突變發(fā)生在種群基因的關(guān)鍵位置,像調(diào)節(jié)基因活動或基因編碼蛋白的重要區(qū)域。例如,他們發(fā)現(xiàn)大于33%的堿基置換發(fā)生在編碼區(qū)域,這同時也改變了基因表達的蛋白產(chǎn)物。在這些物種進化過程中,許多其他的突變往往發(fā)生在生殖系細胞中。不利的突變往往會消失,然而這些有利于物種幸存下來的突變會繼續(xù)遺傳下去。Keinan說:“這就證明了靈長目類物種的抗病毒反應(yīng)機制導(dǎo)致了我們和親緣基因組的形成。”
“看到這些突變對靈長目類動物基因的作用,我很驚訝,”來自安娜堡的密歇根大學(xué)的遺傳學(xué)家Jeffery Kid說,他并沒有參與這項工作。“這使我們意識到,沒有什么是空穴來風(fēng),”病毒引起的DNA的突變機制的平衡是在我們自身DNA的分裂中產(chǎn)生的,他說。“這就引出了一個問題,這一平衡是怎樣達到的呢?”
一些相關(guān)的蛋白質(zhì)或許同樣可以導(dǎo)致基因突變,“這或許只是冰山一角”,Keinan說。他和他的同事正在計算APOBEC蛋白質(zhì)使得人類基因突變的概率。通常,估計一個新生兒會有70個新的基因突變,但只是其中的一種蛋白質(zhì)‘’可以進一步誘導(dǎo)生成數(shù)以千計的蛋白質(zhì)‘’在近親或一代人中,Keinan說。
這就為生物進化的行進提供了許多新的材料。
 

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