微生物是生物界的一個重要類群，是一種重要的生物資源。環(huán)境微生物資源極為豐富，種類多樣，在生物界，種一下分化zui多的生物就是微生物。他們在自然界的物質(zhì)循環(huán)和轉(zhuǎn)化中起著極為重要的作用，不僅維持著生物圈的生態(tài)平衡，而且維持著地球系統(tǒng)的物質(zhì)平衡。這其中一個zui典型的作用就是環(huán)境微生物的生物降解作用，生物降解作用即發(fā)生在水圈，巖石圈，也發(fā)生在大氣中，甚至在生物體內(nèi)也是zui常見的。
　　
　　隨著工業(yè)的發(fā)展和人口的急劇膨脹，排放進入環(huán)境的各種污染物質(zhì)不斷增加，而且污染物的性質(zhì)變化多樣，為了削減所排放的污染物，采用微生物治理的方法越來越多，除了在環(huán)境治理工程中廣泛采用微生物方法以外，一些非工程的措施也會通過微生物的作用獲得有效效果。
　　
　　因此，對于環(huán)境微生物的研究日益興旺。各種有關環(huán)境微生物的研究使得人類有機會更深入的認識環(huán)境微生物，發(fā)現(xiàn)更有益的種類和生物功能。
　　
　　自然環(huán)境中存在的微生物在接納各種各樣的環(huán)境污染物之前是以穩(wěn)定的自然群落，污染物質(zhì)的大量進入。必然引起這個自然群落的大變動。首先是一些不適應污染物的微生物種類從環(huán)境中消失，原有自然環(huán)境中的微生物種群將被新的適應污染環(huán)境的微生物種群所取代，種群間的數(shù)量結(jié)構(gòu)也發(fā)生變化。其次，進入環(huán)境中的污染物質(zhì)可以誘導微生物物種發(fā)生變異，使微生物物種的*質(zhì)粒轉(zhuǎn)移或產(chǎn)生新的致粒，從而誘導出對污染物質(zhì)具有更強的耐受能力和分解能力的微生物新物種，或者更加豐富多樣的變異菌株，使微生物群落更具有高的多樣性。