一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康?nbsp;
學(xué)習(xí)和掌握DNA的微量提取法。
二、實(shí)驗(yàn)原理
小麥黃化苗經(jīng)液氮研磨,可使細(xì)胞壁破裂,加入去污劑(如SDS),可使核蛋白體解析,然后使蛋白和多糖雜質(zhì)沉淀,DNA進(jìn)入水相,再用酚、氯仿抽提純化。本實(shí)驗(yàn)采用SDS法,其主要作用是破膜。SDS屬陰離子去污劑,要溶解膜蛋白與脂肪,也可解聚核蛋白。SDS在溶液中帶負(fù)電荷,能與帶正電荷的蛋白質(zhì)側(cè)鏈結(jié)合成復(fù)合物,當(dāng)加入鉀鹽時(shí),能與SDS-蛋白質(zhì)生成溶解度很小的沉淀一同去除。酚/氯仿/異戊醇的作用是去除核酸制品中的蛋白質(zhì),并有利于水相與有機(jī)相的分開(kāi),而且可以消除泡沫。異丙醇或乙醇的作用是沉淀DNA。
處理DNA樣品時(shí),可在65℃保溫30min,較之37℃處理有以下優(yōu)點(diǎn):①rna酶的zui適作用溫度為65℃;②DNA酶zui適作用溫度為37℃,當(dāng)用65℃處理時(shí),這些酶往往處于活性極低的狀態(tài)而不會(huì)降解DNA;③RNA中的某些總分會(huì)形成發(fā)卡結(jié)構(gòu),65℃處理更有利于這些結(jié)構(gòu)的松散,使RNA酶的作用更*。
三、藥品
1.提取緩沖液
100mmo/L NaCl
100mmol/L Tris-Cl(pH8.0)
50mmol/L EDTA
1%疏基乙醇
2.20%SDS
3.5mol/L
取29.5ml冰醋酸,用KOH顆粒調(diào)校至PH4.8,加水至100ml,室溫保存,不可滅菌。
4.酚/氯仿/異戊醇(25:24:1)
5.異丙醇
6.70%乙醇
四、實(shí)驗(yàn)流程
1.稱(chēng)取0.1g小麥黃化苗葉片于預(yù)冷的研缽中,加入3倍體積(W/V,約300μl)提取緩沖液,在冰盤(pán)上研磨。
2.研碎后轉(zhuǎn)入一EP管中,再加約300μl提取緩沖液。
3.加入20%SDS至終濃度為2%,約66μl。
4.輕輕混勻后于65℃水浴,10min。
5.加入1/10體積的5mol/L(約66μl),于水浴中反應(yīng)30min。
6.離心(15krpm,10min,4℃)。
7.取上相轉(zhuǎn)入一新的EP管中,用等體積的酚/氯仿/異戊醇(25:24:1)抽提一次(上下晃動(dòng)幾次即可)。
8.離心(12krpm,10min,20℃)。
9.取上相轉(zhuǎn)入一新的EP管中,加入等體積的異丙醇,于室溫下反應(yīng)5~10min,其間將管至少顛倒5次。
10.離心(15krpm,10min,4℃)。
11.棄上清液,用70%乙醇沖洗沉淀物,真空抽干或吹干,zui后溶于1×TE中(約50μl)。
五、注意事項(xiàng)
1.研磨后應(yīng)迅速加入提取液,因?yàn)樘崛∫褐泻珽DTA,能夠螯合Mg2+等二價(jià)陽(yáng)離子,防止破碎細(xì)胞中的dna酶降解DNA。
2.提取過(guò)程中,轉(zhuǎn)移上清液時(shí)所用的槍頭用剪刀將尖頭剪去,以避免對(duì)DNA造成的不必要的機(jī)械損傷。
3.干燥DNA時(shí),要注意,過(guò)干或過(guò)濕都不利于DNA的溶解。
所需器材及用具
冰盤(pán)(4個(gè))、研缽(8套)、塑料燒杯(8個(gè))、200μl微量加樣器(2把)、離心機(jī)(1臺(tái))、水浴鍋(65℃)、槍頭及EP管