一 實驗目的
1.掌握質(zhì)粒提取的原理及方法。
2.掌握瓊脂糖凝膠電泳的方法。
二 實驗原理
根據(jù)共價閉合環(huán)狀的質(zhì)粒dna與線性染色體DNA片段之間在拓撲學上的差異發(fā)展起來的。在pH12-12.5時,線性DNA會*變性,而共價閉合環(huán)狀的DNA只是氫鍵斷裂,酸中和后,共價閉合環(huán)狀的DNA迅速準確地復性,而線性DNA聚合成網(wǎng)狀結構,與變性的蛋白和RNA一道離心沉淀,上清液中的質(zhì)粒DNA用乙醇沉淀出來。
三 實驗步驟
已有許多方法用于從細菌中提純質(zhì)粒DNA,這些方法都含有以下3個步驟:
1)細菌培養(yǎng)物的生長。
2)細菌的收獲和裂解。
3)質(zhì)粒DNA的純化。
質(zhì)粒DNA的小量制備可采用下述的堿裂解法或煮沸法。
1.堿裂解法:
(1)在5m1含相應抗生素的lb培養(yǎng)基中接種一單菌落,于37℃劇烈振蕩培養(yǎng)過夜。
(2)將1.5m1培養(yǎng)物倒入Eppendorf管中,用微量離心機于4℃以12000rpm離心30秒。
(3)吸去培養(yǎng)液,使細菌沉淀盡可能干燥。
(4)將細菌沉淀重懸于100μl用冰預冷的溶液I中,劇烈振蕩。
須使細菌沉淀在溶液Ⅰ中*分散,將兩個微量離心管的管底部互相接觸,按圖1所示方法同時進行振蕩,可使沉淀迅速分散。
質(zhì)粒DNA的提取與純化
溶液Ⅰ
50mmol/L 葡萄糖
25mmol/L Tris·CI(pH 8.0)
10mmol/L EDTA(pH 8.0)。
在101bf/in2(6.895×104Pa)高壓下蒸氣滅菌15分鐘,貯存于4℃。
(5)加200μl新配制的溶液Ⅱ.蓋緊管口,快速顛 倒離心管,以混合內(nèi)容物。將離心管放置于冰上。
(6)加150μl用冰預冷的溶液Ⅲ。蓋緊管口,溫和地振蕩10秒鐘使溶液Ⅲ在粘稠的細菌裂解物中分散均勻,之后將管置于冰上3—5分鐘。
(7)4℃ 12000rpm離心10分鐘,將上清轉(zhuǎn)移到另一離心管中。
(8)加等體積氯仿,振蕩混勻, 4℃12000rpm離心10分種,將上清轉(zhuǎn)移到另一離心管中。
(9)用2倍體積的無水乙醇沉淀雙鏈DNA。溫和振蕩混勻,于-18℃放置20分鐘。
(10)用微量離心機于4℃以12000rpm離心10分鐘。
(11)棄上清,加入70%冷乙醇洗沉淀1-2次
(12) 真空干燥DNA沉淀后,將其溶于TE溶液中。
溶液Ⅱ(現(xiàn)用現(xiàn)配)
0.2mol/L NaOH
1% SDS 溶液Ⅲ
5mol/L乙酸鉀 60ml
冰乙酸 11.5ml
水 28.5ml