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上海士鋒生物科技有限公司
中級(jí)會(huì)員 | 第14年

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標(biāo)準(zhǔn)品
培養(yǎng)基
培養(yǎng)基原料 霍亂弧菌診斷血清 大腸艾希氏菌診斷血清 志賀氏菌屬診斷血清 沙門氏菌屬診斷血清 標(biāo)準(zhǔn)血清,診斷血清 抗生素藥敏紙片 微生物配套試劑 微生物生化管 管裝培養(yǎng)基 即用型液體培養(yǎng)基 一次性培養(yǎng)基平板 顯色培養(yǎng)基 臨床培養(yǎng)基 菌種保存培養(yǎng)基 四環(huán)素檢定、厭氧亞硫酸鹽還原桿菌檢測(cè)培養(yǎng)基 維生素檢測(cè)培養(yǎng)基 一次性衛(wèi)生用品衛(wèi)生檢測(cè)培養(yǎng)基 罐頭食品商業(yè)無菌檢測(cè)培養(yǎng)基 飲用水及水源檢測(cè)培養(yǎng)基 藥品、生物制品檢測(cè)培養(yǎng)基 化妝品檢測(cè)培養(yǎng)基 動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)基 啤酒檢驗(yàn)培養(yǎng)基 軍團(tuán)菌檢測(cè)培養(yǎng)基 支原體檢測(cè)培養(yǎng)基 小腸結(jié)腸炎耶爾森氏菌檢驗(yàn)培養(yǎng)基 彎曲桿菌檢驗(yàn)培養(yǎng)基 產(chǎn)氣莢膜梭菌、肉毒梭菌、厭氧菌檢驗(yàn)培養(yǎng)基 阪崎腸桿菌檢驗(yàn)培養(yǎng)基 溶血性鏈球菌檢測(cè)培養(yǎng)基 李斯特氏菌檢測(cè)培養(yǎng)基 弧菌檢測(cè)培養(yǎng)基 乳酸菌、雙歧桿菌檢測(cè)培養(yǎng)基 酵母、霉菌檢測(cè)培養(yǎng)基 檢測(cè)培養(yǎng)基 沙門氏菌、志賀氏菌檢驗(yàn)培養(yǎng)基 大腸菌群、糞大腸菌群、大腸桿菌及腸桿菌科檢測(cè)培養(yǎng)基 細(xì)菌總數(shù)檢測(cè),增菌培養(yǎng)基
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血清
細(xì)胞分離試劑
試劑盒

士鋒PCR反應(yīng)條件的選擇及優(yōu)化

時(shí)間:2017/8/30閱讀:959
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PCR技術(shù)已經(jīng)在生物學(xué)研究和臨床醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)領(lǐng)域中得到了廣泛的應(yīng)用,PCR技術(shù)也日臻完善。PCR技術(shù)操作簡(jiǎn)便,特異性強(qiáng),敏感度*,正因?yàn)槊舾卸雀?,很容易受其他因素的影響,因此要得到?zhǔn)確可靠的反應(yīng)結(jié)果,需根據(jù)不同的模板,摸索的條件,配制出PCR反應(yīng)試劑。
聚合酶鏈反應(yīng)必須具備下述基本條件:模板核酸(DNARNA),人工合成的寡核苷酸引物,合適的緩沖體系,鎂離子,三磷酸脫氧核苷酸,耐熱dna聚合酶,RNA反轉(zhuǎn)錄酶及RNA酶抑制劑(RNasin,溫度循環(huán)參數(shù)(變性、復(fù)性和延伸的溫度與時(shí)間及循環(huán)次數(shù))。

1.模板的選擇

PCR反應(yīng)用DNA(單、雙鏈DNA)或RNA都可以作模板進(jìn)行核酸的體外擴(kuò)增。若起始材料是RNA,須先通過逆轉(zhuǎn)錄得到cDNA后才能進(jìn)行正常pcr擴(kuò)增。核酸標(biāo)本來源廣泛,可以從純培養(yǎng)的細(xì)胞或微生物中直接提取,也可以從臨床標(biāo)本(血、尿、便、痰、體腔積液、漱口水等)、犯罪現(xiàn)場(chǎng)標(biāo)本(血斑、精斑、毛發(fā)等)、病理標(biāo)本(新鮮或固定石蠟包埋標(biāo)本)以及木乃伊標(biāo)本中提取。無論標(biāo)本來源如何,待擴(kuò)增核酸都需部分純化,以使核酸樣品中不混有任何蛋白酶、核酸酶、Taq DNA聚合酶抑制劑以及能結(jié)合DNA的蛋白質(zhì)。雖然PCR可以僅用微量樣品(甚至是來自單一細(xì)胞的DNA),但為保證反應(yīng)的特異性,一般還宜用納克級(jí)(ng)的克隆DNA、微克水平的染色體DNA102-105拷貝的待擴(kuò)增DNA片段做起始材料。

2.引物

PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的大小及擴(kuò)增的靶序列在基因組中的位置是由引物限定的。因此,引物的選擇與合成對(duì)PCR成功與否具有決定性意義。對(duì)某一dna片段來說,由于同源順序的存在,隨意設(shè)計(jì)的兩條引物鏈,其PCR產(chǎn)物經(jīng)電泳分析時(shí)可能會(huì)出現(xiàn)多條電泳帶。因此,在引物的設(shè)計(jì)過程中要考慮引物鏈的特異性,即它們只與被檢測(cè)的DNA片斷互補(bǔ)。

(1) 引物長(zhǎng)度以16-30個(gè)堿基為宜,zui20-24個(gè)bp,不會(huì)形成穩(wěn)定的復(fù)合體。

(2) 有時(shí)引物不起作用,理由不明,可以移動(dòng)序列位置來解決。

(3) G+C%含量一般40%-60%為佳,兩個(gè)引物中(G+C%含量應(yīng)盡量相似。

(4) 兩個(gè)引物之間不應(yīng)發(fā)生互補(bǔ),特別是在引物3’端避免形成引物二聚體。如無法避免,其3’端互補(bǔ)不應(yīng)大于2個(gè)堿基。應(yīng)盡量避免數(shù)個(gè)嘌呤或嘧啶的連續(xù)排列,避免同源序列(尤其6個(gè)以上相同)。

(5) 引物內(nèi)部避免形成次級(jí)結(jié)構(gòu),尤其是發(fā)卡結(jié)構(gòu),必要時(shí)應(yīng)通過計(jì)算機(jī)進(jìn)行結(jié)構(gòu)分析。

(6) 引物濃度不宜偏高,濃度過高有兩個(gè)弊端,一是易形成引物二聚體,二是當(dāng)擴(kuò)增微量靶目標(biāo)并且起始材料又不太純時(shí)容易產(chǎn)生非特異性產(chǎn)物。一般來說,用低濃度引物不僅經(jīng)濟(jì),反應(yīng)特異性也較好。

3.鎂離子濃度

Mg2+濃度對(duì)PCR擴(kuò)增反應(yīng)的特異性和產(chǎn)量有著顯著影響。PCR中常用的體系應(yīng)Mg2+濃度為1.5mmol/L,但對(duì)不同的反應(yīng)體系應(yīng)優(yōu)化Mg2+濃度。濃度過高,使反應(yīng)特異性降低;濃度過低,使產(chǎn)物產(chǎn)量減少。PCR反應(yīng)中Mg2+的加入量要比dNTP濃度高0.5-2.5mmol/L。對(duì)每種PCR反應(yīng)體系Mg2+量的優(yōu)化。另外,還需注意引物和模板DNA原液中是否含EDTA等螯合劑影響游離Mg2+的濃度。

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