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中級(jí)會(huì)員 | 第14年

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標(biāo)準(zhǔn)品
培養(yǎng)基
培養(yǎng)基原料 霍亂弧菌診斷血清 大腸艾希氏菌診斷血清 志賀氏菌屬診斷血清 沙門(mén)氏菌屬診斷血清 標(biāo)準(zhǔn)血清,診斷血清 抗生素藥敏紙片 微生物配套試劑 微生物生化管 管裝培養(yǎng)基 即用型液體培養(yǎng)基 一次性培養(yǎng)基平板 顯色培養(yǎng)基 臨床培養(yǎng)基 菌種保存培養(yǎng)基 四環(huán)素檢定、厭氧亞硫酸鹽還原桿菌檢測(cè)培養(yǎng)基 維生素檢測(cè)培養(yǎng)基 一次性衛(wèi)生用品衛(wèi)生檢測(cè)培養(yǎng)基 罐頭食品商業(yè)無(wú)菌檢測(cè)培養(yǎng)基 飲用水及水源檢測(cè)培養(yǎng)基 藥品、生物制品檢測(cè)培養(yǎng)基 化妝品檢測(cè)培養(yǎng)基 動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)基 啤酒檢驗(yàn)培養(yǎng)基 軍團(tuán)菌檢測(cè)培養(yǎng)基 支原體檢測(cè)培養(yǎng)基 小腸結(jié)腸炎耶爾森氏菌檢驗(yàn)培養(yǎng)基 彎曲桿菌檢驗(yàn)培養(yǎng)基 產(chǎn)氣莢膜梭菌、肉毒梭菌、厭氧菌檢驗(yàn)培養(yǎng)基 阪崎腸桿菌檢驗(yàn)培養(yǎng)基 溶血性鏈球菌檢測(cè)培養(yǎng)基 李斯特氏菌檢測(cè)培養(yǎng)基 弧菌檢測(cè)培養(yǎng)基 乳酸菌、雙歧桿菌檢測(cè)培養(yǎng)基 酵母、霉菌檢測(cè)培養(yǎng)基 檢測(cè)培養(yǎng)基 沙門(mén)氏菌、志賀氏菌檢驗(yàn)培養(yǎng)基 大腸菌群、糞大腸菌群、大腸桿菌及腸桿菌科檢測(cè)培養(yǎng)基 細(xì)菌總數(shù)檢測(cè),增菌培養(yǎng)基
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PCR技術(shù)應(yīng)用進(jìn)展

時(shí)間:2017/6/15閱讀:1111
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原位PCR就是在組織細(xì)胞里進(jìn)行pcr反應(yīng),它結(jié)合了具有細(xì)胞定位能力的原位雜交和高度特異敏感的PCR技術(shù)的優(yōu)點(diǎn),是細(xì)胞學(xué)科研與臨床診斷領(lǐng)域里的一項(xiàng)有較大潛力的新技術(shù).

原位PCRHasse等于1990年建立的,實(shí)驗(yàn)用的標(biāo)本是新鮮組織、石蠟包埋組織、脫落細(xì)胞、血細(xì)胞等.其基本方法為固定組織或細(xì)胞:將組織細(xì)胞固定于預(yù)先用四氟乙烯包被的玻片上,并用多聚甲醛處理,再滅活除去細(xì)胞內(nèi)源性過(guò)氧化物酶.蛋白酶K消化處理:60ug/ml的蛋白酶K將固定好的組織細(xì)胞片55消化處理2h后,962min以滅活蛋白酶K.PCR擴(kuò)增:在組織細(xì)胞片上,加PCR反應(yīng)液,覆蓋并加液體石蠟后,直接放在擴(kuò)增儀的金屬板上,進(jìn)行PCR循環(huán)擴(kuò)增.有的基因擴(kuò)增儀帶有專(zhuān)門(mén)用于原位PCR的裝置.雜交:PCR擴(kuò)增結(jié)束后,用標(biāo)記的寡核苷酸探針進(jìn)行原位雜交.顯微鏡觀察結(jié)果.

原位PCR既能分辯鑒定帶有靶序列的細(xì)胞,又能標(biāo)出靶序列在細(xì)胞內(nèi)的位置,于分子和細(xì)胞水平上研究疾病的發(fā)病機(jī)理和臨床過(guò)程及病理的轉(zhuǎn)歸有重大的實(shí)用價(jià)值.其特異性和敏感性高于一般的PCR.

連接酶鏈反應(yīng)

連接酶鏈反應(yīng)(Ligase chain reactionLCR),是一種新的DNA體外擴(kuò)增和檢測(cè)技術(shù),主要用于點(diǎn)突變的研究及靶基因的擴(kuò)增.

連接酶鏈反應(yīng)是Backman1997年為檢出靶基因序列中的點(diǎn)突變而設(shè)計(jì)發(fā)明,并申報(bào)了.1988Landegren也進(jìn)行了該項(xiàng)研究.1988Backman等又因分離熱穩(wěn)定的連接酶,而申報(bào),1991BackmanBarany分別用耐熱DNA連接酶進(jìn)行了LCR試驗(yàn).耐熱DNA連接酶可以在熱循環(huán)中保持活性,提高連接反應(yīng)的特異性,排除了背景擴(kuò)增和免除了不斷補(bǔ)充酶的繁瑣程序.

LCR的基本原理為利用DNA連接酶.特異地將雙鏈DNA段連接,經(jīng)變性-退火-連接三步驟反復(fù)循環(huán),從而使靶基因序列大量擴(kuò)增.其程序?yàn)?/span>:在模DNADNA連接酶、寡核苷酸引物以及相應(yīng)的反應(yīng)條件下,首先加熱至一定溫度下(9495)使DNA變性,雙鏈打開(kāi),然后降溫退火(65),引物與之互補(bǔ)的模板DNA結(jié)合并留下一缺口,如果與靶序列雜交的相鄰的寡核苷酸引物與靶序列*互補(bǔ),DNA連接酶即可連接封閉這一缺口,則LCR反應(yīng)的三步驟(變性-退火-連接)就能反復(fù)進(jìn)行,每次連接反應(yīng)的產(chǎn)物又可在下一輪反應(yīng)中作模板,使更多的寡核苷酸被連接與擴(kuò)增.若連接處的靶序列有點(diǎn)突變,引物不能與靶序列結(jié)合,缺口附近核苷酸的空間結(jié)構(gòu)發(fā)生變化,連接反應(yīng)不能進(jìn)行,也就不能形成連接產(chǎn)物.

LCR的引物是兩對(duì)分別互補(bǔ)的引物,引物長(zhǎng)度為2026個(gè),以保證引物與靶序列的特異性結(jié)合,LCR識(shí)別點(diǎn)突變的特異性高于PCR,其特異性首先取決于引物與模板的特異性結(jié)合,其次是耐熱連接酶的特異性.LCR連接反應(yīng)溫度接近寡苷酸的解鏈溫度(Tm),因而識(shí)別單核苷酸錯(cuò)配的特異性*.

LCR的擴(kuò)增效率與PCR相當(dāng),用耐熱連接酶做LCR只用兩個(gè)溫度循環(huán),94min變性和65復(fù)性并連接,循環(huán)30次左右.其產(chǎn)物的檢測(cè)也較方便靈敏.目前該方法主要用點(diǎn)突變的研究與檢測(cè)、微生物病原體的檢測(cè)及定向誘變等,還可用于單堿基遺傳病多態(tài)性及單堿基遺傳病的產(chǎn)物診斷,微生物的種型鑒定,癌基因的點(diǎn)突變研究等.

依賴核酸序列的擴(kuò)增

依賴核酸序列的擴(kuò)增(Nucleic acid sequence-based amplification,NASBA),又稱(chēng)自主序列復(fù)制系統(tǒng)(self-sustainedsequence replication,3SR)或再生長(zhǎng)序列復(fù)制技術(shù).1990Guali等首先報(bào)道了這一技術(shù).NASBA主要用于RNA的擴(kuò)增、檢測(cè)及測(cè)序.該反應(yīng)有賴于AMV逆轉(zhuǎn)錄酶,T7RNA多聚酶和核酸酶H(RNaseH)共同協(xié)作而完成.

NASBA反應(yīng)體系中除含有上述三種酶外,還含有dNTPNTP(核糖核苷),
兩種特殊的引物和緩沖液.引物I3"末端與靶序列互補(bǔ),5"端含T7RNA多聚酶的啟動(dòng)子,這一引物是用于合成cDNA.引物的堿基序列與cDNA5"未端互補(bǔ).

NASBA反應(yīng)時(shí),首先引物RNA模板復(fù)性(結(jié)合),AMV逆轉(zhuǎn)錄酶催化合成cDNARNaseH水解cDNA上的RNA,形成一條單鏈的DNA;引物隨即與此cDNA5"未端結(jié)合,逆轉(zhuǎn)錄酶在此DNA模板的指導(dǎo)下合成第二條DNA.這樣形成的DNA雙鏈含有T7RNA多聚酶的啟動(dòng)子.該酶即以此DNA為模板,轉(zhuǎn)錄出與樣品RNA序列相同的RNA鏈,而且每條DNA模板在該酶的作用下可合成約100個(gè)拷貝的RNA.每條新的RNA又可作為逆錄酶的模板合成cDNA.如此反復(fù)進(jìn)行,將獲得更多的RNAcDNA.

其基本方法為:將引物,標(biāo)本加入擴(kuò)增反應(yīng)液,651min使RNA分子二級(jí)結(jié)構(gòu)打開(kāi),降溫至37加入逆轉(zhuǎn)錄酶,T7RNA聚合酶和RNaseH,并在37反應(yīng)11.5小時(shí),其產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖電泳,溴乙錠染色即可在紫外儀下看到條帶.NASBA的特點(diǎn)為操作簡(jiǎn)便,不需特殊儀器,不需溫度循環(huán).整個(gè)反應(yīng)過(guò)程由三種酶控制,循環(huán)次數(shù)少,忠實(shí)性高,其擴(kuò)增效率高于PCR,特異性好.

轉(zhuǎn)錄依賴的擴(kuò)增系統(tǒng)

轉(zhuǎn)錄依賴的擴(kuò)增系統(tǒng)(Transcript-based amplification system,TAS),是Kwen等人于1989年研究報(bào)道的,主要用于擴(kuò)增RNA.

合成A、B引物,引物A3"末端與待擴(kuò)增RNA互補(bǔ),其5"端有T7RNA多聚酶的啟動(dòng)子信息.逆轉(zhuǎn)錄酶以A引物為起點(diǎn)合成cDNA;引物B與此cDNA3"端互補(bǔ)合成cDNA第二鏈.逆轉(zhuǎn)錄酶除具有逆轉(zhuǎn)錄活性外,還有DNA多聚酶的活性及RNaseH的活性.T7RNA多聚酶又以此雙鏈DNA為模板.轉(zhuǎn)錄出與待擴(kuò)增RNA一樣的RNA,這些RNA又可作為下輪反應(yīng)的模板.T7RNA多聚酶的催化效率很高,一個(gè)模板可轉(zhuǎn)錄10103個(gè)RNA拷貝,因而反應(yīng)液中待檢RNA的數(shù)量以10的指數(shù)方式擴(kuò)增.

TAS的主要特點(diǎn)是擴(kuò)增效率高,因?yàn)槠?/span>RNA拷貝數(shù)呈10的指數(shù)方式增加,只需6個(gè)循環(huán)靶序列的拷貝數(shù)就能達(dá)到2×106.它的另一個(gè)特點(diǎn)是特異性高,由于TAS只能進(jìn)行6次溫度循環(huán),錯(cuò)摻率低,加之用葡聚糖珠夾心雜交,因而特異性也高.雖然本法有較高的特異性和敏感性,但其循環(huán)過(guò)程復(fù)雜,需重復(fù)加入逆轉(zhuǎn)錄酶和T7RNA多聚酶,有待進(jìn)一步研究.

復(fù)制酶反應(yīng)

Kacian等于1972年報(bào)報(bào)復(fù)制酶(Q-beta replicase)催化RNA模板的自我復(fù)制功能,它能在常溫30min,將其天然模模MDV-1RNA擴(kuò)增至109.1986Chu等報(bào)道用生物標(biāo)記的靶序列特異性探針,可與親和素聯(lián)接的MDV-1RNA雜交,經(jīng)洗脫未被結(jié)合的MDV-1后,再加入復(fù)制酶,擴(kuò)增復(fù)制MDV-1拷貝,然后用溴乙錠染色檢測(cè)或用同源性的第二探針雜交.

復(fù)制酶是一種RNA指導(dǎo)的RNA聚合酶,它有3個(gè)特點(diǎn):不需寡核苷酸引物的引導(dǎo)就可啟動(dòng)RNA的合成.能特異地識(shí)別RNA基因中由于分子內(nèi)堿基配對(duì)而形成的*的RNA折疊結(jié)構(gòu).復(fù)制酶的天然模板MDV-1RNA的非折疊結(jié)構(gòu)區(qū)插入一短的核酸序列不影響該酶的復(fù)制.因而,如在此區(qū)插入核酸探針,則其序列照樣可能被復(fù)制酶擴(kuò)增.

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