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中級(jí)會(huì)員 | 第14年

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施一公新文章揭示PSH蛋白晶體結(jié)構(gòu)

時(shí)間:2012/12/24閱讀:1996
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2012年12月19日,清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院施一公教授帶領(lǐng)其研究組在《自然》雜志以研究長(zhǎng)文(Research Article)的形式發(fā)表了題為《早老素家族天冬氨酸膜整合蛋白酶的結(jié)構(gòu)》(Structure of a presenilin family intramembrane aspartate protease)的研究論文,報(bào)道了人的早老素蛋白(presenilin) 在古細(xì)菌Methanoculleus marisnigri JR1中同源蛋白PSH的晶體結(jié)構(gòu)。

阿茲海默癥(Alzheimer disease,AD),又稱老年癡呆癥,是一種致死性神經(jīng)退行性疾病。目前研究認(rèn)為,阿茲海默癥是由于γ-secretase活性中心蛋白早老素(presenilin)發(fā)生突變,從而導(dǎo)致其對(duì)底物淀粉樣前體蛋白(APP)的酶切位點(diǎn)發(fā)生改變,形成更容易在大腦中沉積的β淀粉樣蛋白(Aβ)導(dǎo)致的。因此, 對(duì)γ-secretase活性中心蛋白早老素的晶體學(xué)研究,能夠幫助人們更清楚地了解阿茲海默癥的發(fā)病機(jī)理,進(jìn)而為阿茲海默癥提供理論依據(jù)。

施一公教授的研究組一直以來將γ-secretase及其同源蛋白的結(jié)構(gòu)與功能作為主要研究方向。經(jīng)過多年努力,他們今年獲得了早老素在古細(xì)菌中同源蛋白PSH的結(jié)構(gòu)。PSH與人源早老素蛋白有著高達(dá)50%的序列相似性,進(jìn)化上高度保守。PSH蛋白三維晶體結(jié)構(gòu)呈現(xiàn)出全新的“presenilin fold”折疊方式。該蛋白由9個(gè)跨膜螺旋組成,穿膜螺旋1-6形成N端結(jié)構(gòu)域(NTD),7-9形成C端結(jié)構(gòu)域(CTD);兩個(gè)催化殘基天冬氨酸(D162和D220)分別位于穿膜螺旋6和7上,并且包埋在膜內(nèi)。通過結(jié)構(gòu)分析,并且結(jié)合之前相關(guān)的生化研究結(jié)果,研究組提出了底物以及水分子進(jìn)入PSH的通道模型。之后,研究組又基于序列的高度保守性,利用計(jì)算機(jī)同源建模,搭建了人源早老素蛋白的三維結(jié)構(gòu)。根據(jù)該模型,進(jìn)一步對(duì)引發(fā)阿茲海默癥相關(guān)早老素突變殘基進(jìn)行了生化研究。

在這篇新文章中,研究人員報(bào)告了來自黑海甲烷袋狀菌JR1的presenilin/SPP同源物(PSH)的晶體結(jié)構(gòu)。這一蛋白酶包括9個(gè)跨膜區(qū) (TMs),采用了一種從前未報(bào)告過的蛋白質(zhì)折疊方式。其氨基(N)端區(qū)域,由TM1–6構(gòu)成,形成了一種馬蹄形狀的結(jié)構(gòu),環(huán)繞著TM7–9構(gòu)成的羧(C)基端區(qū)域。兩個(gè)催化天冬氨酸殘基定位在TM6和TM7的胞質(zhì)側(cè)上,空間上相互接近。水分子通過N端和C端區(qū)域之間的一個(gè)大口袋接近催化天冬氨酸。

通過這一結(jié)構(gòu)分析,研究人員獲得了對(duì)presenilin/SPP家族膜內(nèi)蛋白酶的認(rèn)識(shí)。從而為未來更深入地了解presenilin、γ-secretase和SPP的結(jié)構(gòu)和機(jī)制提供了重要的框架。

這一研究是施一公教授繼2006年和2007年在《自然-結(jié)構(gòu)與分子生物學(xué)》(Nature Structural & Molecular Biology)和《科學(xué)》(Science)分別發(fā)表Rhomboid和Site-2 protease兩個(gè)家族的膜整合蛋白酶的晶體結(jié)構(gòu)之后,對(duì)zui后一個(gè)家族,天冬氨酸膜整合蛋白酶的重要結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究成果,推近了人們對(duì)阿茲海默癥致病機(jī)理的認(rèn)識(shí)和理解,也為之后基于晶體結(jié)構(gòu)的藥物設(shè)計(jì)和篩選打下了良好的基礎(chǔ)。

清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院王佳偉博士參與合作,生命科學(xué)學(xué)院的博士研究生李曉淳和黨尚宇為文章的共同*作者。

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