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標簽:熒光檢測,熒光強度, 熒光定量pcr, 定量pcr,熒光筆
熒光定量PCR 是PCR實驗中常見的PCR類型,下面歸納一下,客戶進行PCR實驗時常遇見的一些問題。希望對具有PCR恐懼癥的伙伴們能有所幫助。
常見問題一: 熒光定量PCR的類型有幾種?有何區(qū)別?
答:目前熒光定量PCR實驗常用的方法主要有兩種,即:SYBR Green I染料法和Taqman探針法,兩者的主要區(qū)別在于:SYBR Green 染料的特點是只與DNA雙鏈相結(jié)合發(fā)出熒光,而當熒光染料處在游離狀態(tài)時,不會發(fā)出熒光。所以在PCR循環(huán)體系中熒光信號強度與PCR產(chǎn)物的數(shù)量成正比例關(guān)系。染料法熒光定量的優(yōu)點是通用性比較強,幾乎適用于所有的熒光定量PCR反應(yīng)但也具有明顯非特異性。如果PCR反應(yīng)過程中出現(xiàn)引物二聚體或者進行非特異性擴增時,該染料也會這些非特異性擴增產(chǎn)物結(jié)合從而激發(fā)熒光,形成假陽性信號,對PCR定量結(jié)果一定的干擾,從而影響到PCR定量結(jié)果的準確性。
常見問題二:熒光定量實驗中無擴增曲線是什么原因?qū)е?/span>?
答:一般來說,在熒光定量PCR實驗中,無擴增曲線主要會有以下三種情況:
凝膠電泳時無條帶出現(xiàn),無擴增曲線。
這種情況需要考慮引物的設(shè)計是否合理?引物質(zhì)量是否正常?退火溫度設(shè)置是否合理?擴增體系是否正常等等。
2.第二種情況比較容易出現(xiàn)的是在做電泳時會正常顯示條帶,但沒有明顯的擴增曲線。這種情況有可能是探針合成過程出現(xiàn)問題;如果探針過程正常,則需要檢查探針淬火溫度、程序參數(shù)設(shè)定問題確排除后則可能是儀器故障導(dǎo)致。
3.另外,模板被降解或模板不足時也會出現(xiàn)無曲線擴增現(xiàn)象。
常見問題三:熒光定量PCR時,有哪些需要注意的?
答:在進行熒光定量PCR實驗室時,需要注意以下幾點:
1.PCR實驗室要有獨立的分區(qū):一般PCR實驗室的樣品處理區(qū)、PCR反應(yīng)制備區(qū)、PCR擴增區(qū),數(shù)據(jù)報告區(qū)等相互獨立使用放置DNA污染;
2.配置標準品的工具,包括移液器、吸頭等單獨使用一套工具,并且移液器的吸頭是帶濾芯的標準吸頭。
3.盡量不要用記號筆或標簽在PCR管上做標記,以免影響儀器的熒光檢測4.PCR管或8排管使用完后,及時歸入在的廢棄放置區(qū),不要與試驗區(qū)域內(nèi)的樣本混用。
5.每個步驟都需要做好防止DNA貨RNA污染措施。
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