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蛋白質(zhì)免疫共沉淀(CoIP)實(shí)驗(yàn)方案

時(shí)間:2023-6-20閱讀:781

溶液和試劑

裂解緩沖液

這些緩沖液可在 ℃ 下保存數(shù)周,或者以分裝形式在 -20 ℃ 下保存長(zhǎng)達(dá) 年。

Nonidet-P40 (NP40) 緩沖液

150 mM NaCl

1.0% NP40(可用 0.1% Triton X-100 替代)

50 mM Tris-HCl pH 8.0

蛋白酶抑制劑(一定要添加,推薦 cocktail 形式的,貨號(hào) A10004

RIPA 緩沖液(放射免疫沉淀試驗(yàn)緩沖液)

150 mM NaCl

1.0% NP-40  0.1% Triton X-100

0.5% 脫氧膽酸鈉

0.1% SDS(十二烷基硫酸鈉)

50 mM Tris-HCl pH 8.0

蛋白酶抑制劑(一定要添加,推薦 cocktail 形式的,貨號(hào) A10004

Tris-HCl 緩沖液

20 mM Tris-HCl pH 7.5

蛋白酶抑制劑(一定要添加,推薦 cocktail 形式的,貨號(hào) A10004

電泳、轉(zhuǎn)膜、封閉緩沖液

Laemmli 2×緩沖液/上樣緩沖液

4% SDS


20% 甘油

0.004% 溴酚藍(lán)

0.125 M Tris-HCl

測(cè)定 pH 并調(diào)節(jié)至 pH 6.8

電泳緩沖液(Tris-ganansuan/SDS

25 mM Tris 

190 mMganansuan

0.1% SDS

測(cè)定 pH,pH 應(yīng)為約 8.3。必要時(shí)進(jìn)行調(diào)節(jié)。

轉(zhuǎn)膜緩沖液(濕轉(zhuǎn))

25 mM Tris 

190 mM ganansuan

20% 甲醇

測(cè)定 pHpH 應(yīng)為約 8.3。必要時(shí)進(jìn)行調(diào)節(jié)。

對(duì)于大于 80 kDa 的蛋白質(zhì),推薦加入最終濃度為 0.1%  SDS。

轉(zhuǎn)膜緩沖液(半干轉(zhuǎn))

48 mM Tris

39 mMganansuan

20% 甲醇

0.04% SDS

封閉緩沖液

5% 奶粉(推薦使用,也可以用 BSA 牛血清白蛋白)

加入 TBST 緩沖液中。混勻并過(guò)濾。過(guò)濾失敗可能導(dǎo)致出現(xiàn)“斑點(diǎn)",其中微小的黑色顆粒

會(huì)在顯色過(guò)程中污染印跡。

實(shí)驗(yàn)步驟

A. 制備細(xì)胞裂解物

1. 吸干培養(yǎng)基。添加含有調(diào)節(jié)分子的新鮮培養(yǎng)基,使其在預(yù)定的時(shí)間內(nèi)對(duì)細(xì)胞進(jìn)行處理。

2. 收集細(xì)胞,去除培養(yǎng)基后用冰預(yù)冷的 1X PBS 洗滌細(xì)胞一次。

3. 去除 PBS,并在并在細(xì)胞培養(yǎng)容器中加入適量的已經(jīng)添加了 Cock tail 蛋白酶抑制劑的

Lysis buffer。每 107 個(gè)細(xì)胞加入 1ml 冰預(yù)冷的 Lysis buffe(相當(dāng)于 100mm 的培養(yǎng)皿,150cm2

的培養(yǎng)瓶),并在冰上孵育至少 分鐘。

4. 從板上刮下細(xì)胞,把提取物轉(zhuǎn)移至微量離心管。置于冰上。

5. 在冰上進(jìn)行 次超聲破碎,每次 秒。如果沒(méi)有超聲儀,請(qǐng)用帶注射器的針頭(20G-18G-

16G)冰上反復(fù)抽吸,直到裂解液澄清;

6.  4°C,在 14,000 x g 條件下,微量離心 10 分鐘,將上清轉(zhuǎn)移到新管中。上清液即為細(xì)胞裂解物。如有必要,裂解物可保存在 –80°C。

注:細(xì)胞裂解物制備好之后,可先進(jìn)行蛋白免疫印跡法檢測(cè),以此來(lái)確定細(xì)胞裂解物里存在

目標(biāo)蛋白。

B. 抗原抗體結(jié)合

1. 在新的離心管內(nèi)加入 500μl(含總蛋白 200-1000ug)細(xì)胞裂解物。

2. 加入目標(biāo)蛋白的單克隆/多克隆抗體(1-10μg,根據(jù)抗體使用說(shuō)明書(shū))。

3. 同時(shí)采用非特異免疫的同源抗體作為對(duì)照。

4.  4℃輕柔混合過(guò)夜。

C. 免疫復(fù)合物沉淀

1. 抗體孵育過(guò)夜后,加入 20μl Protein A/G。

2.  4℃溫和地混勻 1-3 小時(shí)或過(guò)夜。

3. 12000g 離心 1min,保留沉淀。

4. 使用 0.5ml 1*Wash buffer 清洗沉淀,12000g 離心 1min,保留沉淀。

5. 重復(fù)第 步,共計(jì)清洗 次。

注:清洗,去上清的時(shí)候需要注意避免吸走填料

D. 用蛋白免疫印跡法進(jìn)行分析

1.  20-50 μl 1* SDS 樣品緩沖液中重懸沉淀物。渦旋振蕩,然后再微量離心 30 秒。

2. 將樣品加熱至 95100°并持續(xù) 2-5 分鐘,然后在 14,000 x g 下瞬時(shí)離心 分鐘。

3. 將樣品 (15-30 μl) 上樣到 SDS-PAGE 凝膠上。

4. 用蛋白質(zhì)印跡法分析樣品。

如果抗體輕重鏈污染會(huì)影響結(jié)果分析,可選擇 Abmart 的避重輕鏈二抗來(lái)解決這個(gè)問(wèn)題,產(chǎn)品貨號(hào):M20014-M20018


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