化學(xué)合成類藥物生產(chǎn)過程復(fù)雜，工藝過程反應(yīng)步驟多，一種原料藥往往有十幾步甚至幾十步反應(yīng);參與藥物合成過程的母核、前體、側(cè)鏈、保護(hù)基、輔劑等物質(zhì)的種類多、利用率低、生產(chǎn)過程產(chǎn)生的廢棄物量大、成分復(fù)雜，對環(huán)境的污染危害影響嚴(yán)重。其生產(chǎn) 廢水中的污染物是以化學(xué)合成物質(zhì)為主，同時含有大量殘留藥物效價及其降解物以及不同的鹽類等，其廢水較發(fā)酵類廢水具有更強(qiáng)的生化抑制毒性。廢水直接采用一般的生化方法進(jìn)行處理，污染物去除效率較低，處理后的廢水很難達(dá)到排放標(biāo)準(zhǔn)要求。目前，制藥廢水經(jīng)過二級處理以后仍達(dá)不到新標(biāo)準(zhǔn)的排放要求，而且其二級出水水中含有的有機(jī)成分都是難以生物降解的、可生化性極差的，所以不易再采用生物的方法進(jìn)行處理。

但是如果可以通過預(yù)處理的制藥廢水二級出水的可生化性提高，則還是優(yōu)先考慮用生物的方法進(jìn)行處理。因?yàn)樵趶U水處理領(lǐng)域，生物法技術(shù)上比較成熟、效果上也比較穩(wěn)定，且處理成本低廉，這些都是其它深度處理方法*的。由于好氧生化處理法對于中低度的有機(jī)廢水有很好的處理效果，因此在制藥廢水的深度處理中，采用預(yù)處理-好氧生物處理相結(jié)合的組合工藝是比較適宜的。目前深度處理中研究較多的好氧生物處理技術(shù)有生物活性炭法、曝氣生物濾池、生物接觸氧化法、生物流化床及膜生物反應(yīng)器等。