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PCR反應(yīng)體系內(nèi)部因素

2025-5-6  閱讀(14)

  一個(gè)PCR反應(yīng)過程分為很多的步驟,包括樣本采集,運(yùn)輸,核酸提取,qpcr擴(kuò)增等步驟,因此結(jié)果會(huì)受到很多因素的影響,本文將常見因素分為內(nèi)部因素和外部因素,內(nèi)部因素是指正常試劑體系中的成分,外部因素是指環(huán)境或者樣本帶入的因素。
 
  體系內(nèi)部因素:
 
  1、引物:長(zhǎng)度、擴(kuò)增跨度、特異性等因素;
 
  2、酶及其濃度:酶濃度過高可引起非特異性擴(kuò)增,濃度過低則合成產(chǎn)物量減少;
 
  3、dNTP的質(zhì)量與濃度:dNTP溶液呈酸性,一般配置成體系需將其調(diào)節(jié)至7.0-7.5,正常情況下4種dNTP的濃度應(yīng)該相等,如果其中某一種過高就會(huì)引起錯(cuò)配,濃度過低又會(huì)引起PCR產(chǎn)物的產(chǎn)量。不過目前使用的都是商品化配置好的預(yù)混液體系;
 
  4、模板核酸:模板核酸的量和純度,是PCR成敗與否的關(guān)鍵環(huán)節(jié)之一,對(duì)于RNA模板更要注意RNA的降解;
 
  5、Mg2+濃度:主要影響PCR擴(kuò)增的特異性和產(chǎn)量,Mg2+濃度過高,反應(yīng)特異性降低,出現(xiàn)非特異性擴(kuò)增,濃度過低會(huì)降低Taq 酶的活性,使反應(yīng)產(chǎn)物減少;
 
  6、溫度與時(shí)間的設(shè)置:變性溫度與時(shí)間、退火溫度與時(shí)間、延伸溫度與時(shí)間;
 
  7、循環(huán)次數(shù):循環(huán)次數(shù)決定PCR擴(kuò)增程度,PCR循環(huán)次數(shù)主要取決于模板DNA的濃度。一般溫度循環(huán)次數(shù)在30-40次之間,循環(huán)次數(shù)越多,非特異性產(chǎn)物的量就越多。
 


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