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閱讀：295發(fā)布時(shí)間：2017-5-4
一項(xiàng)針對丙型肝炎病毒（HCV）和500多名HCV感染者的大數(shù)據(jù)研究有助更好地理解這種病毒如何與它的人宿主相互作用。
來自英國、瑞士、美國、加拿大、比利時(shí)和瑞典的研究人員開發(fā)出一種方法來分析和比較HCV的遺傳組成，以及500多名HCV感染者的遺傳組成。通過一起加以研究，這將讓研究人員對HCV和人基因組如何與這種病毒相互作用并且改變這種病毒提供新的見解。相關(guān)研究結(jié)果于2017年4月10日在線發(fā)表在Nature Genetics期刊上，論文標(biāo)題為"Genome-to-genome analysis highlights the effect of the human innate and adaptive immune systems on the hepatitis C virus"。論文通信作者為來自英國牛津大學(xué)的Ellie Barnes教授和Chris Spencer博士。
病毒性肝炎是*死亡和殘疾的主要原因之一，2%～3%的世界人口被認(rèn)為感染上HCV。在英國，據(jù)估計(jì)，有30萬人感染上這種病毒。很多人并沒有意識到他們感染上這種病毒，未接受治療，從而導(dǎo)致肝病和肝癌。
Barnes說，"這是利用一項(xiàng)大數(shù)據(jù)研究一同探究了一種病毒和它的宿主。我們鑒定出人基因組中的兩個(gè)位點(diǎn)，在這兩個(gè)位點(diǎn)發(fā)生的調(diào)節(jié)著我們的免疫系統(tǒng)的遺傳變異影響這種病毒的遺傳多樣性。"
"可用的新藥物能夠清除HCV感染，但是它們是非常昂貴的，而且當(dāng)前對它們的獲得是受到限制的。這些藥物也比其他的藥物不難么有效地治療存在的7種HCV毒株中的一些毒株導(dǎo)致的感染。這突出強(qiáng)調(diào)了理解這種疾病的遺傳基礎(chǔ)在未來開發(fā)新的療法中的重要性。"
"在15年內(nèi)，對HCV等致病性微生物的DNA測序?qū)⒆兂山】滇t(yī)療的一個(gè)常規(guī)的部分。這種信息能夠被用來調(diào)整每名病人的療法，從而有助確保這些病人服用的藥物或在恰當(dāng)?shù)臅r(shí)間里zui有可能控制這種感染或者從這種感染中康復(fù)過來。"
STOP-HCV是由英國醫(yī)學(xué)研究委員會（MRC）資助的和在英國牛津大學(xué)領(lǐng)導(dǎo)下的一個(gè)全國聯(lián)盟。該聯(lián)盟的研究人員正在開發(fā)大的遺傳數(shù)據(jù)集以便改善HCV療法，和更好地理解HCV感染的生物學(xué)特征。
這項(xiàng)研究特別關(guān)注了隨著時(shí)間的移改變HCV的兩個(gè)人基因位點(diǎn)。
人基因組的一個(gè)位點(diǎn)（即HLA基因，編碼人白細(xì)胞抗原分子）揭示出HCV基因組中試圖發(fā)生突變來逃避人免疫系統(tǒng)識別的那些序列。這些研究人員利用這些數(shù)據(jù)繪制出HCV基因組的這些選擇性壓力的圖譜，從而能夠被用來找出對這種病毒存活至為關(guān)鍵的弱點(diǎn)。這些弱點(diǎn)能夠被作為開發(fā)新的療法或疫苗的靶標(biāo)。
這項(xiàng)研究關(guān)注的人基因組的第二個(gè)影響這種病毒的位點(diǎn)激活在一些人體內(nèi)被關(guān)閉的一個(gè)免疫基因（編碼干擾素-λ先天免疫系統(tǒng)中的組分）。激活這個(gè)基因的影響是改變病人血液中存在的HCV病毒數(shù)量。
對病人的DNA和HCV的DNA的大規(guī)模分析將為研究人免疫系統(tǒng)天然地對HCV感染作出反應(yīng)的方式和這如何影響病毒進(jìn)化提供機(jī)會
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