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細(xì)胞STR鑒定背景介紹:
在過去的 45 年里,細(xì)胞生物學(xué)方面的數(shù)據(jù)一直在發(fā)表,但是應(yīng)用于生物醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域的哺乳動物細(xì)胞被錯誤鑒定和交叉污染的問題,一直是一個普遍存在的突出問題。早在1970年代,一項研究就發(fā)現(xiàn),被廣泛使用的Hela細(xì)胞系就曾被污染,這一事件當(dāng)時就促使*細(xì)胞系質(zhì)量控制手冊的誕生。HeLa細(xì)胞株是由正常子宮頸細(xì)胞被一 人類乳突狀瘤病毒(Human Papillomavirus 18或HPV18)轉(zhuǎn)型成癌細(xì)胞的,而且和正常子宮頸細(xì)胞有許多不同。
從那時候開始,細(xì)胞身份鑒定成 一個受科學(xué)家關(guān)注的問題,也是從那時候開始越來越多的細(xì)胞被污染事件開始出現(xiàn)。人們已經(jīng)開始意識到細(xì)胞被污染的問題,導(dǎo)致細(xì)胞交叉污染的原因和預(yù)防措施也已經(jīng)被公布,然而問題卻一直有增無減,研究人員繼續(xù)發(fā)表從錯誤鑒定和交叉污染的細(xì)胞系所獲取的數(shù)據(jù)。
據(jù)估計, 國外實驗室已建株細(xì)胞有接近 20% 存在上述問題, 有 15-25% 的研究論文因為使用了被錯誤辨識和交叉污染的細(xì)胞而導(dǎo)致錯誤的結(jié)論。這造成大量研究經(jīng)費的浪費,并產(chǎn)生了大量無效或錯誤數(shù)據(jù)。
2008年,Josephine Nefkens研究所的分子生物學(xué)家Winand Dinjens與同事發(fā)現(xiàn)食管腺癌細(xì)胞其實與食管扁平細(xì)胞癌細(xì)胞系具有相似的基因型。這些結(jié)果促使他們開始關(guān)注細(xì)胞身份問題。 Dinjens開始驗證這些細(xì)胞系,將它們與原始的組織進(jìn)行基因型比對,結(jié)果發(fā)現(xiàn),這些細(xì)胞系與原始組織細(xì)胞已經(jīng)有不同的基因型。
在13株食管腺癌細(xì)胞系中,其中3株:SEG-1,BIC-1和SK-GT-5被污染,這些細(xì)胞株混合有其他癌細(xì)胞。這些細(xì)胞系已經(jīng)被多家實驗室應(yīng)用在兩個臨床試驗、并發(fā)表了超過100篇SCI文章,并申請了11個美國,這一研究結(jié)果被發(fā)布在一期的Journal of the National Cancer Institute(JNCI)。
2007 年 NIH發(fā)布了通知,強(qiáng)烈建議在使用培養(yǎng)細(xì)胞的時候進(jìn)行鑒定(authentication)。2008 年底,專家提議ATCC致力于人源細(xì)胞系的鑒定工作,并制定鑒定的標(biāo)準(zhǔn)程序。
近年來,大量研究表明 STR 基因分型 方法是進(jìn)行細(xì)胞交叉污染和性質(zhì)鑒定的zui有效和準(zhǔn)確的方法之一,STR基因分型應(yīng)用于細(xì)胞鑒定已被ATCC等機(jī)構(gòu)強(qiáng)烈*。美國的ATCC 細(xì)胞庫、德國的DSMZ細(xì)胞庫以及日本的JCRB細(xì)胞庫等為STR 分型提供了各細(xì)胞株的數(shù)據(jù)供比對。
標(biāo)準(zhǔn)的制定:
2011年初,美國菌種保藏中心(ATCC)制定了人源細(xì)胞系STR鑒定標(biāo)準(zhǔn),旨在約束因細(xì)胞交叉污染和錯誤辨識所導(dǎo)致的無效科研數(shù)據(jù)的不斷擴(kuò)增。更重要的是,細(xì)胞系的鑒定在研發(fā)基于細(xì)胞下的醫(yī)學(xué)產(chǎn)品時起到至關(guān)重要的作用,它能避免將人體細(xì)胞暴露于錯誤鑒定細(xì)胞中的風(fēng)險。
您是否有過這樣的經(jīng)歷……
在科研工作結(jié)束之際,被你所投稿的雜志要求提供細(xì)胞鑒定報告,而此時你研究中使用的細(xì)胞是否被污染,將決定你幾個月甚至長達(dá)幾年的科研工作的成敗。
您是否有過這樣的經(jīng)歷……
新買到的細(xì)胞、實驗室傳了幾代的細(xì)胞,又或者儲存于超低溫冰箱幾年不用的細(xì)胞, 被污染了么? 鑒定正確么?用它做研究會影響實驗結(jié)果么?
沒有經(jīng)過相應(yīng)的細(xì)胞鑒定,使用了被污染的細(xì)胞,花費了大量的時間、物力和人力,寫出了一篇論文,但是結(jié)論被推,論文被召回,大量的時間、物力和人力都被浪費,一切都要從頭再來。如果你是等待畢業(yè)的學(xué)生,等待你的將是延期畢業(yè)。
選擇正確的細(xì)胞,是實驗成功的一半
細(xì)胞是一種很特殊的商品,由于其具有可復(fù)制性,因此很容易被一些商家自行復(fù)制后再出售,而這些自行傳代復(fù)制的細(xì)胞幾乎*,所以很容易引起大家購買。但是這些細(xì)胞傳代的次數(shù)、培養(yǎng)的條件以及是否有污染等都無法得到保障,甚至有老師買了這種細(xì)胞做了很多的實驗都沒有結(jié)果,很長時間之后才發(fā)現(xiàn)細(xì)胞被污染了。
大部分生物實驗都需要一個大量的時間、精力和金錢的過程,為了讓您的時間、精力、財力不會因為使用了錯誤的細(xì)胞而浪費,我們建議您在實驗之前,對您所使用的細(xì)胞進(jìn)行細(xì)胞鑒定,以確保您使用的細(xì)胞的正確性,讓您的實驗有一個良好的開端。
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