深圳子科生物報(bào)道：蛋白質(zhì)液-液相分離(Liquid-liquid phase separation, LLPS)，是細(xì)胞內(nèi)眾多無膜細(xì)胞器(membraneless organelles)和生物分子凝聚體(biomolecular condensates)動(dòng)態(tài)組裝的主要驅(qū)動(dòng)力。鑒定相分離蛋白需要多種實(shí)驗(yàn)，其中，體外重構(gòu)相分離實(shí)驗(yàn)通過嚴(yán)格控制各種條件，可以更方便地研究相分離現(xiàn)象；而細(xì)胞內(nèi)，尤其是生理?xiàng)l件下相分離現(xiàn)象的鑒別檢測，對于研究相分離蛋白的生物學(xué)功能*。

近年來，圍繞相分離的研究不斷涌現(xiàn)，發(fā)現(xiàn)了各種新的相分離相關(guān)蛋白，涉及到許多重要的生物學(xué)過程。但是，領(lǐng)域內(nèi)卻缺乏系統(tǒng)性整合體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的相分離相關(guān)蛋白數(shù)據(jù)庫。

2019年10月4日，北京大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)生物信息學(xué)系李婷婷研究組、清華大學(xué)陳陽研究組、歐洲生物信息研究所Henning Hermjakob研究組在Nucleic Acids Research雜志上在線發(fā)表文章“PhaSepDB: a database of liquid–liquid phase separation related proteins”，發(fā)布了目前首包含體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的液-液相分離相關(guān)蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫PhaSepDB，為進(jìn)一步研究體內(nèi)外蛋白質(zhì)液-液相分離形成機(jī)制、蛋白特征以及在病理過程中潛在作用提供數(shù)據(jù)支持。

PhaSepDB對近年來發(fā)表文獻(xiàn)、Uniprot數(shù)據(jù)庫內(nèi)已有相分離相關(guān)蛋白信息進(jìn)行人工記錄及整合，目前已收錄2914個(gè)相關(guān)蛋白的4018條信息，涵蓋三十多種無膜細(xì)胞器，提供相分離相關(guān)蛋白介紹、蛋白物質(zhì)狀態(tài)、相關(guān)突變或疾病、對應(yīng)文獻(xiàn)內(nèi)容、相分離相關(guān)序列特征分析以及免疫熒光圖像；同時(shí)，相應(yīng)網(wǎng)站提供基于無膜細(xì)胞器的圖形化導(dǎo)航（圖2），并支持搜索以及下載相分離相關(guān)蛋白。數(shù)據(jù)庫將會(huì)持續(xù)更新，歡迎大家使用并提供寶貴意見。

北京大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院八年制博士生游鎧強(qiáng)、第二臨床醫(yī)學(xué)院八年制本科生黃齊、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院八年制博士生余春雨為論文共同作者,李婷婷副教授、陳陽助理研究員、Henning Hermjakob研究員為共同通訊作者。

原文標(biāo)題：

PhaSepDB: a database of liquid–liquid phase separation related proteins