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轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)合蛋白質(zhì)組分析探索蠑螈再生奧秘

時間：2013-4-16閱讀：161
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來自德國及美國等處的研究人員針對基因組特別大，難以進行全基因組測序的動物，提出了以轉(zhuǎn)錄組測序與蛋白質(zhì)組分析聯(lián)合以解析功能基因的策略，并以蠑螈進行實驗，開辟了組織及器官再生研究的新思路。
然而蠑螈的基因組十分龐大，比人類基因組大十倍，要從頭獲得蠑螈的全基因組序列不容易。因此研究者們將目光轉(zhuǎn)向基因表達所產(chǎn)生的RNA，他們利用454新一代測序技術(shù)對蠑螈的轉(zhuǎn)錄組進行了研究。經(jīng)過從頭組裝N. viridescens的轉(zhuǎn)錄組，獲得了超過120,000個RNA轉(zhuǎn)錄本，約有15,000個轉(zhuǎn)錄本編碼蛋白質(zhì)，其中有826個轉(zhuǎn)錄本是蠑螈所*的。這些轉(zhuǎn)錄本中包含了不同器官所有再生階段的轉(zhuǎn)錄本，這些轉(zhuǎn)錄本中的一部分與其它生物相似。通過對蠑螈胚胎和幼體的心臟、四肢、眼睛、尾、肝臟、脾臟等組織中再生過程表達的蛋白的分離以及質(zhì)譜分析方法，對這些蛋白進行分類及與轉(zhuǎn)錄本的比對。生物通
通過454新一代測序結(jié)果與質(zhì)譜技術(shù)的結(jié)合，發(fā)現(xiàn)了500多個其它生物中從未被發(fā)現(xiàn)的肽段，接下來會進一步探索這些蛋白是否與再生能力相關(guān)。這項研究不僅為目前科學(xué)家們提供了兩棲類動物的基因數(shù)據(jù)，更為基因組測序困難的動物研究，提出了一種新思路。
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