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上海滬宇生物科技有限公司

研究人員操縱Set2途徑揭示基因忠實的復制機制

時間:2012-8-29閱讀:348
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    基因表達的*步就是利用RNA聚合酶II將一段DNA地拷貝到鏡像RNA之中??茖W家們認識到pol II并不沿著DNA高速軌道輕柔地滑動來將它轉(zhuǎn)錄為RNA,相反它在緊密地纏繞著被稱作組蛋白的屏障蛋白的DNA上遭遇著重重障礙。在之前的研究中,美國斯托瓦斯醫(yī)學研究所研究員Jerry Workman博士證實一旦一輪轉(zhuǎn)錄完成之后,為了阻止?jié)撛谟泻Φ腞NA的片段表達,在生化上與pol II結合的蛋白Set2如何恢復抑制性的組蛋白環(huán)境。他的研究團隊利用Set2發(fā)生突變的酵母揭示出細胞利用一個令人吃驚的機制來維持基因表達繼續(xù)進行下去,不論是在合適環(huán)境之下,還是在不合適的環(huán)境之下,如像癌細胞中那樣。

 

    兩類染色質(zhì)重塑因子相互競爭來激活或抑制基因表達。“激活者”通過利用乙酰基修飾組蛋白從而讓組蛋白放松對DNA的控制,這就讓組蛋白脫離DNA從而允許pol II通過DNA高速軌道上的重重障礙。另一類發(fā)揮相反作用的染色質(zhì)重塑因子,包括Set2,通過植入它們自己的被稱作甲基的生化標記,接著吸引一種酶來移除乙?;鶑亩謴腿旧|(zhì)到一種不可訪問的狀態(tài),zui終終止基因表達。這種抑制確保錯誤的轉(zhuǎn)錄起始并不在一個基因的隱蔽位點上發(fā)生。

 

    在此之前,很多人猜測盡管染色質(zhì)重塑因子對組蛋白進行乙酰化和去乙?;墙M蛋白仍然與一條DNA鏈保持接觸。論文*作者Swami Venkatesh博士認為某類組蛋白交換在轉(zhuǎn)錄期間發(fā)生,但是人們并不確認在整個基因上,這種交換是否會發(fā)生。為了研究潛在的組蛋白交換,研究人員對釀酒酵母進行改造以便追蹤標記的組蛋白進出染色質(zhì),這樣就可以評估組蛋白的化學修飾。利用這種系統(tǒng),他們比較了正常酵母和Set2發(fā)生突變的酵母中全部6000個基因的全部乙?;图谆V。

 

    他們首先在正常細胞中,Set2植入的抑制性甲基化標記位于正在表達中的基因片段的兩側(cè),而且正如期待中的那樣,在Set2發(fā)生突變的酵母中,這種標記是缺失的。在這些酵母突變體中,大部分基因的乙?;瘶擞浵喾磿黾?,這也可以從Set2招募去乙?;傅哪芰G失來加以解釋。進一步的分析揭示這些乙酰(雙乙酰化的組蛋白中的很多蛋白事實上并不嵌入在染色質(zhì)之中,相反它們是從外面“進口”而來的,或者說它們事先已發(fā)生乙?;?。這比較重要,這是因為細胞不用招募一種重構酶來對組蛋白再次乙?;?。這些研究還揭示Set2在控制基因表達中發(fā)揮著比期待中更加復雜的作用。Workman解釋道,“Set2植入在組蛋白上的甲基標記發(fā)揮著兩種功能。它不僅招募去乙酰化酶來移除組蛋白上的乙酰標記,而且這些新發(fā)現(xiàn)提示著它還阻止事先乙酰化的組蛋白整入到基因之中。”

 

    研究人員利用芯片分析還將這些化學修飾與異常的基因表達相關聯(lián)在一起:不同于正常的酵母,Set2發(fā)生突變的酵母產(chǎn)生眾多截斷的隱蔽RNA轉(zhuǎn)錄本。在注意到這些截斷的RNA鏈之后,Workman同意道,它們可能干擾正常的RNA表達為蛋白。人也有Set2蛋白的對等物,即SETD2,據(jù)報道,它們作為腫瘤抑制物而發(fā)揮作用,而且在包括乳腺癌和腎癌在內(nèi)的幾種類型的癌癥中,它的活性丟失了。鑒于組蛋白交換實際上在很大程度上發(fā)生,所以這也有助于人們找到抗癌療法。

 

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