晶體學(xué)和計(jì)算機(jī)模型技術(shù)揭示細(xì)菌對抗生素耐藥的分子機(jī)制
近日,刊登在雜志Journal of the American Chemical Society (JACS)上的一篇研究報(bào)告中,來自布里斯托大學(xué)和葡萄牙阿威羅大學(xué)的研究者通過研究揭示了一種特定酶的結(jié)構(gòu),這種酶可以破壞碳青霉烯類抗生素,抑制抗生素發(fā)揮作用,這種抗生素可以抑制一系列的嚴(yán)重感染。
細(xì)菌如大腸桿菌可以通過產(chǎn)生特定的碳青霉烯酶來抑制碳青霉烯類抗生素作用的發(fā)揮,從而來破壞其抗菌活性,繼續(xù)進(jìn)行感染。碳青霉烯酶是細(xì)菌β內(nèi)酰胺酶的家族成員,β內(nèi)酰胺酶可以破壞*類及其相關(guān)的抗生素,但是為何碳青霉烯酶可以破壞碳青霉烯類抗生素(其它β內(nèi)酰胺酶不能破壞)的分子機(jī)制并不清楚。
在這項(xiàng)研究中,研究者使用分子動(dòng)力學(xué)模型,揭示了特定類型的碳青霉烯酶如何結(jié)合至抗生素,并促進(jìn)其破壞使其效用失效。研究者使用X射線晶體衍射技術(shù)對碳青霉烯酶破壞碳青霉烯類抗生素的過程進(jìn)行拍照,隨后進(jìn)行動(dòng)態(tài)模擬實(shí)驗(yàn)?zāi)M抗生素被破壞的過程。
在模擬過程中,研究者就可以看到碳青霉烯類抗生素被破壞的詳細(xì)過程,理解此過程可以幫助研究者開發(fā)出新型的藥物來抑制碳青霉烯類抗生素被破壞。
研究者Spencer說,結(jié)合實(shí)驗(yàn)技術(shù)和計(jì)算機(jī)技術(shù)我們就可以得到細(xì)菌對抗生素產(chǎn)生耐藥的一系列起源信息,我們的晶體學(xué)結(jié)果揭示了抗生素被破壞的全部過程,這就為開發(fā)新型細(xì)菌酶類結(jié)合藥物,來抑制細(xì)菌耐藥性提供了基礎(chǔ)。
研究者zui后表示,識別細(xì)菌酶類和抗生素的分子反應(yīng),對于我們開發(fā)新型修飾藥物來克服細(xì)菌的抗生素耐藥性帶來了很大幫助。