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聚丙烯酰胺凝膠電泳的操作方法

閱讀:404發(fā)布時間:2010-9-29

聚丙烯酰胺凝膠電泳的操作方法。聚丙烯酰胺凝膠電泳  聚丙烯酰氨凝膠電泳作用:用于分離蛋白質(zhì)和寡糖核苷酸。    作用原理 聚丙烯酰胺凝膠電泳是網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),具有分子篩效應。它有兩種形式:(1)非變性聚丙烯酰胺凝膠,在電泳的過程中,蛋白質(zhì)能夠保持完整狀態(tài),并依據(jù)蛋白質(zhì)的分子量大小、蛋白質(zhì)的形狀及其所附帶的電荷量而逐漸呈梯度分開。   而SDS-PAGE僅根據(jù)蛋白質(zhì)亞基分子量的不同就可以分開蛋白質(zhì)。該技術(shù)zui初由shapiro于1967年建立,他們發(fā)現(xiàn)在樣品介質(zhì)和丙烯酰胺凝膠中加入離子去污劑和強還原劑后,蛋白質(zhì)亞基的電泳遷移率主要取決于亞基分子量的大小(可以忽略電荷因素)。
作用
  SDS是陰離子去污劑,作為變性劑和助溶試劑,它能斷裂分子內(nèi)和分子間的氫鍵,使分子去折疊,破壞蛋白分子的二、三級結(jié)構(gòu)。而強還原劑如巰基乙醇,二硫蘇糖醇能使絆*殘基間的二硫鍵斷裂。在樣品和凝膠中加入還原劑和SDS后,分子被解聚成多肽鏈,解聚后的氨基酸側(cè)鏈和SDS結(jié)合成蛋白- SDS膠束,所帶的負電荷大大超過了蛋白原有的電荷量,這樣就消除了不同分子間的電荷差異和結(jié)構(gòu)差異。   SDS-PAGE一般采用的是不連續(xù)緩沖系統(tǒng),于連續(xù)緩沖系統(tǒng)相比,能夠有較高的分辨率。   濃縮膠的作用是有堆積作用,凝膠濃度較小,孔徑較大,把較稀的樣品加在濃縮膠上,經(jīng)過大孔徑凝膠的遷移作用而被濃縮至一個狹窄的區(qū)帶。當樣品液和濃縮膠選TRIS/HCL緩沖液,電極液選TRIS/*。電泳開始后,HCL解離成氯離子,*解離出少量的*根離子。蛋白質(zhì)帶負電荷,因此一起向正極移動,其中氯離子zui快,*根離子zui慢,蛋白居中。電泳開始時氯離子泳動率zui大,超過蛋白,因此在后面形成低電導區(qū),而電場強度與低電導區(qū)成反比,因而產(chǎn)生較高的電場強度,使蛋白和*根離子迅速移動,形成以穩(wěn)定的界面,使蛋白聚集在移動界面附近,濃縮成一中間層。   此鑒定方法中,蛋白質(zhì)的遷移率主要取決于它的相對分子質(zhì)量,而與所帶電荷和分子形狀無關。
蛋白質(zhì)在聚丙烯酰胺凝膠中電泳時,它的遷移率取決于它所帶凈電荷以及分子的大小 和形狀等因素。如果加入一種試劑使電荷因素消除,那電泳遷移率就取決于分子的大小,就可以用電泳技術(shù)測定蛋白質(zhì)的分子量。1967年,Shapiro等發(fā)現(xiàn)陰離子去污劑十二烷基硫酸鈉(SDS)具有這種作用。當向蛋白質(zhì)溶液中加入足夠量SDS和巰基乙醇,SDS可使蛋白質(zhì)分子中的二硫鍵還原。由于十二烷基硫酸根帶負電,使各種蛋白 質(zhì)—SDS復合物都帶上相同密度的負電荷,它的量大大超過了蛋白質(zhì)分子原的電荷量, 因而掩蓋了不同種蛋白質(zhì)間原有的電荷差別,SDS與蛋白質(zhì)結(jié)合后,還可引起構(gòu)象改 變,蛋白質(zhì)—SDS復合物形成近似“雪茄煙”形的長橢圓棒,不同蛋白質(zhì)的SDS復合物的短軸長度都一樣,約為18A,這樣的蛋白質(zhì)—SDS復合物,在凝膠中的遷移率,不 再受蛋白質(zhì)原的電荷和形狀的影響,而取決于分子量的大小由于蛋白質(zhì)-SDS復合物在單位長度上帶有相等的電荷,所以它們以相等的遷移速度從濃縮膠進入分離膠,進入分離膠后,由于聚丙烯酰胺的分子篩作用,小分子的蛋白質(zhì)可以容易的通過凝膠孔徑,阻力小,遷移速度快;大分子蛋白質(zhì)則受到較大的阻力而被滯后,這樣蛋白質(zhì)在電泳過程中就會根據(jù)其各自分子量的大小而被分離。因而SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳可以用于測定蛋白質(zhì)的分子量。當分子量在15KD到200KD之間時,蛋白質(zhì)的遷移率和分子量的對數(shù)呈線性關系,符合下式:logMW=K-bX,式中:MW為分子量,X為遷移率,k、b均為常數(shù),若將已知分子量的標準蛋白質(zhì)的遷移率對分子量對數(shù)作圖,可獲得一條標準曲線,未知蛋白質(zhì)在相同條件下進行電泳,根據(jù)它的電泳遷移率即可在標準曲線上求得分子量。   SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳經(jīng)常應用于提純過程中純度的檢測,純化的蛋白質(zhì)通常在SDS電泳上應只有一條帶,但如果蛋白質(zhì)是由不同的亞基組成的,它在電泳中可能會形成分別對應于各個亞基的幾條帶。SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳具有較高的靈敏度,一般只需要不到微克量級的蛋白質(zhì),而且通過電泳還可以同時得到關于分子量的情況,這些信息對于了解未知蛋白及設計提純過程都是非常重要的。


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