系統(tǒng)生物學的發(fā)展歷史
實驗方法與系統(tǒng)方法構(gòu)成科學研究的基本方法，19世紀是實驗生物學（生態(tài)、生理、遺傳與醫(yī)學等）范式建立，20世紀是實驗生物學迅速發(fā)展和系統(tǒng)生物學（生態(tài)、生理、遺傳與醫(yī)學等）范式形成。系統(tǒng)科學（包括控制論、信息論）根源于生命科學，發(fā)展了計算機科學而又應(yīng)用于生物科學，將開發(fā)出生物計算機。維納與香農(nóng)從動物與通訊行為的研究中提出控制論與信息論，整個系統(tǒng)科學根植于有機體哲學思維。系統(tǒng)生物學，zui初開創(chuàng)于貝塔郎菲的一般系統(tǒng)理論與理論生物學，艾根的超循環(huán)理論發(fā)展了細胞、生物化學與分子層次的系統(tǒng)論。20世紀70年代召開了“系統(tǒng)論與生物學” （systems theory and biology） 會議，80年代召開了生物化學系統(tǒng)論、生物系統(tǒng)的計算機模型等探討的會議 （第11屆分子系統(tǒng)生物學會議2009 年6 月于中科院上海召開）。系統(tǒng)生物學的概念在20世紀中葉已經(jīng)提出，合成生物學的概念提出于基因重組技術(shù)的產(chǎn)生，進化理論、有機分子合成可以說是zui早的探索。
系統(tǒng)生物學的發(fā)展經(jīng)歷了三個歷史時期：*期，生態(tài)系統(tǒng)，系統(tǒng)生態(tài)學與行為、心理學，開始于 20 世紀60~70 年代；第二期，生理系統(tǒng)，系統(tǒng)生理學與神經(jīng)、內(nèi)分泌、免疫學，開始于20世紀70~80年代；第三期，遺傳系統(tǒng)，系統(tǒng)遺傳學與胚胎、發(fā)育生物學，系統(tǒng)遺傳學的概念與詞匯于20 世紀90 年代中科院曾邦哲（曾杰）發(fā)表，并于1996年主辦第1 屆轉(zhuǎn)基因動物學術(shù)研討會（秘書長）闡述了系統(tǒng)論與生物工程、輸卵管生物反應(yīng)器及基因組進化與生物體發(fā)育自組織系統(tǒng)理論，遺傳學從染色體行為的細胞遺傳學、基因表達信息流的分子遺傳學，發(fā)展到了系統(tǒng)遺傳學的細胞發(fā)生信號傳導與基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)研究，并重新于第19屆遺傳學大會闡述（包括指出C. Nuslein-Volhard、S. Brenner[7]等是較早以systematic方法研究遺傳學的科學家）。2008 年3 月美國加州舉辦了整合與系統(tǒng)遺傳學會議，2009 年10月荷蘭召開了系統(tǒng)遺傳學研討會。 1999 年初于德國建立系統(tǒng)生物科學與工程網(wǎng)及籌備聯(lián)合協(xié)會、會議等 （1999 年10 月Nature 和12 月Kybernetes），曾邦哲（ZengBJ）定義生物系統(tǒng)理論與實驗、計算 （computational）、工程方法的生物系統(tǒng)分析與人工生物系統(tǒng)研究，并闡述其自組織系統(tǒng)結(jié)構(gòu)理論基礎(chǔ)，1999-2000年將籌備通知發(fā)送到系統(tǒng)科學、計算機科學、納米科學、生物醫(yī)學、生物工程等廣泛領(lǐng)域的科學家（包括邀請C. Nuslein-Volhard、Tomita等科學家），細胞是由大規(guī)模生物分子（納米）構(gòu)成的復雜生物系統(tǒng)，基因組是可以重編程序的智能系統(tǒng)，生命系統(tǒng)人工設(shè)計與改造，可以開發(fā)出細胞生物機器。 2000 年同期，日本Kitnano 和Tomita 舉辦系統(tǒng)生物學會議，美國Hood 建立系統(tǒng)生物學研究所，美國 Kool 重新提出合成生物學的概念。2001年WolkenhauerO.6月（9月出版）、Ideker T & Hood L9月和Kitano H.10月（MIT出版2000年會議論文集）等發(fā)表文章論述系統(tǒng)生物學的系統(tǒng)論、組學和計算方法等，2002年日本北野宏明（Kitano H.）[8]、2003年美國胡德（Hood L.）[9]也論述了系統(tǒng)生物學是實驗與計算方法整合的生物系統(tǒng)研究，2008年Nature文章[10]則論述了系統(tǒng)生物學與合成生物學的結(jié)構(gòu)理論。2005年Ideker贊同是如同Kitnano的分子水平的系統(tǒng)生物學概念，2007年Kinano闡釋系統(tǒng)生物學是在分子生物學層次的重新提出。計算生物技術(shù)、組學 （omics） 生物技術(shù)與合成生物技術(shù)，構(gòu)成系統(tǒng)生物學發(fā)展的技術(shù)基礎(chǔ) - 系統(tǒng)生物技術(shù) （systems biotechnology），現(xiàn)代系統(tǒng)生物學是生物系統(tǒng)的理論與技術(shù)整合的研究體系。21 世紀伊始，刊物 Nature、Science 發(fā)表系統(tǒng)生物學、合成生物學等?？K于進入了系統(tǒng)生物科學（簡稱系統(tǒng)生物學）化迅速發(fā)展時代。
