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RNA測序技術(shù)

2010-10-14  閱讀(4020)

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摘要: 來自美國特拉華大學(xué)的科學(xué)家們在小分子RNAs研究方面做出了重大貢獻(xiàn):他們發(fā)現(xiàn)擬南芥中的RNAs實際數(shù)目比以前所知的多10倍以上。

來自美國特拉華大學(xué)的科學(xué)家們在小分子RNAs研究方面做出了重大貢獻(xiàn):他們發(fā)現(xiàn)擬南芥中的RNAs實際數(shù)目比以前所知的多10倍以上。

小分子RNAs是近十年來生命科學(xué)界zui重要的發(fā)現(xiàn)之一,這些核糖核酸雖然小,但是卻在動植物基因調(diào)控中扮演著重要的角色。植物體內(nèi)如果缺乏小分子RNAs就會對植物生長有復(fù)雜長久的影響,而且小分子RNAs也參與了其它一些重要的生理過程,比如抗逆性。

為了能夠了解生物機體中小分子RNAs的整體作用與個體生物角色,確定體內(nèi)RNAs的序列是十分之必要的。雖然之前也有不同動植物的幾千個小分子RNAs被測序確定,但是這些傳統(tǒng)方法不能夠在基因組的水平上進(jìn)行完整的測序,得到的結(jié)果缺乏豐度和整體規(guī)則感。

特拉華的研究人員利用一種稱之為“大規(guī)模平行信號測序系統(tǒng)”(Massively Parallel Signature Sequencing,MPSS)轉(zhuǎn)錄組分析技術(shù)的方法來進(jìn)行擬南芥的測序。這一由英國劍橋大學(xué)獨立出來的Solexa公司開發(fā)的技術(shù)(現(xiàn)Takara也在其DNA Micro-beads Array技術(shù)中運用)是一種利用EST序列數(shù)據(jù)庫分析基因轉(zhuǎn)錄信息的分析方法,改善了之前令科學(xué)家頭痛的耗時耗力的實驗過程。

利用這一技術(shù),研究人員完成了擬南芥種子和花朵22,000,000個小分子RNAs的測序,并發(fā)現(xiàn)了75,000個未發(fā)現(xiàn)的小分子RNA序列。而在這之前,擬南芥中總共也才測序了6,000個小分子RNAs。而且利用MPSS得到的結(jié)果數(shù)量多,質(zhì)量也較好,在這項研究中,研究者們發(fā)現(xiàn)了許多高調(diào)控的小分子RNAs。

除了獲得了序列信息,特拉華大學(xué)研究人員也發(fā)現(xiàn)了一個令他們驚訝的結(jié)果:之前推測認(rèn)為非轉(zhuǎn)錄活性區(qū)域被證明是龐大數(shù)量小分子RNAs的活性區(qū)域。這些發(fā)現(xiàn)對于未來RNA和轉(zhuǎn)錄調(diào)控的研究有非常重要的意義,并且也預(yù)示著這一領(lǐng)域的研究在將來一定會蓬勃發(fā)展。

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