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Nature子刊構(gòu)建人類脂肪組織lncRNAs資源庫(kù)

時(shí)間:2018-4-25閱讀:372
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來(lái)自溫州醫(yī)科大學(xué),杜克-新加坡國(guó)立大學(xué)的研究人員發(fā)表了題為“De novo reconstruction of human adipose transcriptome reveals conserved lncRNAs as regulators of brown adipogenesis”的文章,對(duì)人類胎兒棕色脂肪、成人內(nèi)臟和皮下脂肪分別進(jìn)行了深度RNA-seq測(cè)序,由此構(gòu)建包含3149個(gè)lncRNAs的人類脂肪組織活性目錄,并由此建立了一個(gè)可以在脂肪細(xì)胞發(fā)育中發(fā)現(xiàn)功能性lncRNAs的路線圖。

這一研究成果公布在4月6日的Nature Communications雜志上,文章的通訊作者分別為溫州醫(yī)科大學(xué)的徐聃與杜克-新加坡國(guó)立大學(xué)醫(yī)學(xué)院的孫磊,溫州醫(yī)科大學(xué)丁春明為論文的*作者及并列通訊作者,林艷卿為并列*作者。

由于糖尿病,血脂異常和高血壓等代謝風(fēng)險(xiǎn)因素的影響,肥胖已經(jīng)成為越來(lái)越受關(guān)注的健康危機(jī)。之前的研究證明了lncRNA在調(diào)節(jié)小鼠脂肪發(fā)育中的多方面作用,但它們?cè)谌祟愔炯?xì)胞中的意義仍然尚屬于空白。

脂肪細(xì)胞分為棕色脂肪細(xì)胞和白色脂肪細(xì)胞,這兩者有著明顯的形態(tài)學(xué)區(qū)別,它們的生物學(xué)功能也大不相同。棕色脂肪組織在全身的能量代謝調(diào)控中起著重要的作用,它可以“燃燒”掉多余的能量從而減少體內(nèi)以脂肪形式堆積的能量。

 

過(guò)去的觀點(diǎn)認(rèn)為,在嚙齒類動(dòng)物的一生中都存在棕色脂肪組織,而人的肩胛區(qū)的棕色脂肪只存在于幼年階段,并隨著我們的成長(zhǎng)而退化,所以以前的觀點(diǎn)認(rèn)為成年人體內(nèi)沒(méi)有棕色脂肪組織。但新近利用成像技術(shù)的研究表明,成年人在頸-鎖骨區(qū)域有相當(dāng)數(shù)量的Ucp1陽(yáng)性的脂肪細(xì)胞,其活性與BMI呈負(fù)相關(guān),而與基礎(chǔ)代謝速率呈正相關(guān)。

此前,研究人員分離并鑒定了多個(gè)棕色脂肪組織發(fā)育的蛋白調(diào)控因子,而近期的高通量測(cè)序中獲得的新證據(jù)顯示,大量的長(zhǎng)非編碼RNAs(lncRNAs)在脂肪發(fā)育過(guò)程中被嚴(yán)格調(diào)控。盡管缺乏蛋白質(zhì)編碼能力,但lncRNAs在脂肪發(fā)育和代謝過(guò)程中仍行使重要功能。

這一研究團(tuán)隊(duì)的早期研究發(fā)現(xiàn)了一組對(duì)小鼠棕色脂肪發(fā)育*的lncRNAs 如lncBATE1、lncBATE10 和 Blnc1。近期孫磊團(tuán)隊(duì)又在小鼠中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)對(duì)leptin有調(diào)控作用的lncRNA (lnc-Leptin)。

但由于大多數(shù)lncRNA在小鼠和人之間的保守性較差,人的脂肪樣本采集困難,因此至今缺乏完整的人的脂肪的lncRNA目錄,特別是在棕色脂肪中,阻礙了我們對(duì)人體脂肪中l(wèi)ncRNA的理解。

在這篇文章中,研究人員構(gòu)建了包含3149個(gè)lncRNAs的脂肪活性目錄,其中909個(gè)是通過(guò)對(duì)成人皮下,網(wǎng)膜白色脂肪組織和胎兒脂肪進(jìn)行深度RNA-seq,特異性檢測(cè)到的,318個(gè)是人和小鼠之間保守的lncRNAs。而且169種保守的人類lncRNA與其附近的mRNAs呈正相關(guān)。

此外,研究人員發(fā)現(xiàn)其中一個(gè)保守的lncRNA:lnc-dPrdm16,是棕色脂肪發(fā)育所必需的調(diào)控因子。

這項(xiàng)成果為今后研究人類脂肪中的lncRNAs提供了一個(gè)有價(jià)值的資源,而且也建立了一個(gè)可以在脂肪細(xì)胞發(fā)育中發(fā)現(xiàn)功能性lncRNAs的路線圖。

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