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簡介高遷移率族蛋白B1

時間:2017-5-2閱讀:975
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簡介高遷移率族蛋白B1基本信息

高遷移率族蛋白于1973年在牛胸腺中被提取和鑒定,因其在聚丙烯酰胺凝膠電泳中的高遷移能力而得名。具體可參見Ferrari S, Finelli P, Rocchi M, Bianchi ME (July 1996). "The active gene that encodes human high mobility group 1 protein (HMG1) contains introns and maps to chromosome 13". Genomics 35 (2): 367–71. doi:10.1006/ge996.0369. PMID8661151.。根據(jù)分子質量大小、序列相似性和DNA結構特性,HMG可進一步分為HMGA、HMGB、HMGN 3個家族。而HMGB家族又有3個成員,即HMGB1、HMGB2和HMGB3,三者在氨基酸序列上有80%的一致性。HMGB1是含量zui豐富的HMG蛋白,在典型的哺乳動物細胞內約有106個分子,平均10~15個核小體即可含有1個HMGB1分子。HMGB1廣泛分布于淋巴組織、腦、肝、肺、心、脾、腎等組織中,HMGB1除在肝、腦組織中主要存在于胞漿外,在大多數(shù)組織中存在于胞核;而HMGB2/3分布較局限,HMGB2僅分布在淋巴組織中,HMGB3僅在胚胎中被發(fā)現(xiàn),二者可能與胚胎發(fā)育有關。HMGB1先前也稱HMG1,在進化過程中其氨基酸序列高度保守,嚙齒類動物與人的氨基酸序列同源性高達98%以上,小鼠與大鼠氨基酸序列同源性更是高達。

簡介高遷移率族蛋白B1結構

(1)人類HMGB1基因位于13q12染色體上。HMGB1基因包括5個外顯子和4個內含子[5]。HMGB1基因有十分強大的TATA盒啟動子。它的zui大活性是猴病毒40(SV 40)啟動子的18倍。這個啟動子還包括數(shù)個轉錄因子結合位點,如激活蛋白1(AP1)。此外還包含一個沉默元件(silencer element),因此,在一般環(huán)境條件下,HMGB1的表達量維持在基礎水平[6]。HMGB1基因敲除后幼鼠仍能存活,但存在廣泛的形態(tài)畸形,多于出生24 h內死亡。

(2)人類HMGB1的初級氨基酸序列中含有219個氨基酸殘基,成熟HMGB1分子質量為30 ku。HMGB1蛋白由3個*的結構域組成。其中A-box位于N-末端,進化高度保守;C-tail在羧基末端,包含30個重復的天冬氨酸和谷氨酸殘基,可參與調節(jié)HMGB1與DNA結合的親和力;B-box位于二者之間。A-box和B-box均由3個α螺旋組成,并帶有強烈的正電荷,構成HMGB1的非特異性DNA結合區(qū)。HMGB1釋放至胞外后,B-box是引起炎癥反應的功能結構域,而A-box對B-box有一定的拮抗作用[7]。此外,人們把一個與A-box和B-box結構域同源,約含85個氨基酸的重復區(qū)命名為DNA結合基元,為區(qū)別起見,將DNA結合基元的蛋白稱為HMG-box。HMG-box起源古老,其中包括序列特異性DNA結合蛋白和非特異性結合蛋白,系辨認和結合變形DNA所必需的結構[8]。HMGB1在不同的物種中高度保守,大鼠與小鼠的HMGB1蛋白序列*一致,與人類HMGB1蛋白的不同點只是C末端重復序列中有2個殘基被置換。

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