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*酰化探針的制備實(shí)驗(yàn)

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*?;结樀闹苽鋵?shí)驗(yàn)
實(shí)驗(yàn)材料    DNA
試劑、試劑盒    DNA聚合酶dNTP2-疏基乙醇*甘油NaClEDTASDS無水乙醇
儀器、耗材    注射器電泳儀離心機(jī)培養(yǎng)箱
實(shí)驗(yàn)步驟    
1.  混合以下物質(zhì)于100 μl 反應(yīng)體積:

(1)10 μl  10×大腸桿菌DNA聚合酶Ⅰ緩沖液

(2)10 μl  0.5 mmol/l 3dNTP混合液

(3)10 μl  0.5 mmol/l *-11-dNTP貯存液

(4)10 μl  0.5 mmol/l 2-ME

(5)2 μg  DNA

(6)20 U  大腸桿菌聚合酶Ⅰ

(7)DNA酶Ⅰ貯存液,用錢用冷水稀釋1000倍

(8)加水到100 μl,15℃溫育2~2.5 h。

2.  取6 μl 反應(yīng)液,煮沸3 min 置于冰浴2 min。
 
3.  加樣于瓊脂糖凝膠,同時(shí)帶對照分子量標(biāo)準(zhǔn),在15 V/cm 電壓降下電泳。
 
4.  消化的DNA大小介于100~500 bp 之間,接步驟5繼續(xù),若大小在500~1 000核苷酸之間(或更大)加入第二份DNA酶Ⅰ繼續(xù)溫育。
 
5.  加入2 μl,0.5 mol/l pH8.0的EDTA和1 μl 10%SDS,68℃加熱10 min 終止反應(yīng)和滅活DNA酶Ⅰ。
 
6.  在1 ml 注射器中準(zhǔn)備如Sephadex G-50離心柱,用2 ml 無水乙醇清洗注射器和硅化的玻璃棉。

7.  接著用4ml H2O沖洗,將G-50介質(zhì)裝入注射器至刻度,用100 μl SDS柱緩沖液冼3~4次,上樣。

8.  分離*?;奶结?。探針濃度應(yīng)約為20 ng/μl ,探針可直接使用,也可在-20℃保存數(shù)年而不喪失活性。
 
9.  用比色法估計(jì)*?;磻?yīng)的程度和探針的質(zhì)量或進(jìn)行化學(xué)發(fā)光檢測。

隨即寡核苷酸引物合成法

實(shí)驗(yàn)材料    DNA
試劑、試劑盒    dNTP*klenow酶TEEDTALiCl乙醇
儀器、耗材    離心機(jī)培養(yǎng)箱
實(shí)驗(yàn)步驟    
1.  在1. 5 ml 離心管中加入500 ng~2 μg 模板DNA,加水至總體積為34 μl。
 
2.  在沸水中變性DNA 5 min 置于冰浴5 min,稍加旋離。

3.  按順序加入下列溶液:

(1)10 μl  *?;S即多聚體

(2)5 μl  dNTP/*混合物

(3)1 μl  klenow酶(5U)

(4)37℃溫育1 h。
 
4.  加入3 μl 0.5 mol/l EDTA pH8.0以終止反應(yīng)。加入5 μl 4 mol/l LiCl和150 μl 冰冷的無水乙醇,置于冰浴30 min。

5.  室溫高速離心10 min,沉淀用70%乙醇洗滌。
 
6.  DNA用20 μl pH7.5的TE緩沖液重懸。用比色法或化學(xué)發(fā)光法估價(jià)*?;磻?yīng)的效果。


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