因方向族聚酰胺反滲透膜與含有余氯的水接觸將膜元件造成無法修復的損傷，所以在對反滲透設備及管路進行殺菌，化學清洗。如果有殘余氯存在，要使用亞硫酸氫鈉還原殘余氯，并保持足夠的接觸時間以保證還原。

短期保存方法適用于RO膜停止運行5-30天的反滲透系統(tǒng)。此時反滲透膜元件仍安裝在RO系統(tǒng)的壓力容器內(nèi)，保存操作的具體步驟：

用給水沖洗反滲透系統(tǒng)，同時注意將氣體從系統(tǒng)中排除掉。

如果反滲透膜元件長期停用保護措施

如果反滲透膜停用30天以上，膜元件仍安裝在壓力容器的反滲透系統(tǒng)。

應該進行如下保護：

清洗反滲透膜系統(tǒng)中的膜元件。

在反滲透系統(tǒng)重新投入使用前，用低壓給水沖洗系統(tǒng)1小時，然后在用高壓給水系統(tǒng)5-10分鐘，無論低壓沖洗還是高壓沖洗，系統(tǒng)的產(chǎn)水排放閥應全部打開，在恢復系統(tǒng)至正常操作前，應檢查并確認產(chǎn)品水中不含任何殺菌劑。