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行業(yè)產(chǎn)品
RNA產(chǎn)品特點(diǎn):
1.針對(duì)血液樣本*配置,操作更簡單、流程更優(yōu)化。
2.配有高效的DNaseⅠ,可有效去除DNA污染。
3.配有CS過濾柱,可有效去除其它雜質(zhì)。
4.RNA純度更高,無雜質(zhì)殘留,特別適合于對(duì)純度要求很高的下游實(shí)驗(yàn)。
5.操作安全可靠,無需酚/氯仿抽提,無需氯化銫梯度離心,無需氯化鋰或乙醇沉淀
用于血液樣本處理對(duì)RNA測序數(shù)據(jù)影響的研究
以血液這一為常用的臨床樣本為研究對(duì)象,重點(diǎn)研究了血液儲(chǔ)存時(shí)間以及外周血單核細(xì)胞(PBMC)樣本分離方法對(duì)其RNA測序數(shù)據(jù)質(zhì)量的研究,對(duì)測序數(shù)據(jù)質(zhì)量及準(zhǔn)確度進(jìn)行了探索分析,在差異表達(dá)基因分析的基礎(chǔ)上找到了一些規(guī)律性變化且與儲(chǔ)存時(shí)間相關(guān)的基因。
該研究能夠拓展高通量測序在臨床相關(guān)研究中的應(yīng)用,促進(jìn)其進(jìn)一步發(fā)展。論文的主要研究內(nèi)容如下:
1. 在PBMC樣本研究中,通過比較不同樣品處理間的基因表達(dá)差異,發(fā)現(xiàn)隨著貯藏時(shí)間的延長,差異逐漸擴(kuò)大,而對(duì)總基因的影響不顯著。在PBMC測序數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)了5個(gè)隨時(shí)間呈梯度差異的基因,它們都是免疫相關(guān)基因,這些基因在以前的研究中沒有提及,這提示我們按照常規(guī)的生物標(biāo)記分子篩選方法而不注重樣本處理無疑會(huì)產(chǎn)生偏差。此外,離心速度的影響大于保存時(shí)間,不同的離心速度可誘導(dǎo)差異表達(dá)。本文還分析了不同的貯存時(shí)間和離心速度對(duì)相同樣品的影響,為血液保存時(shí)期如何操作和處理樣本提供了理論依據(jù)。
2.在全血樣本研究中,通過比較相同樣品不同儲(chǔ)存時(shí)間的基因表達(dá)差異,發(fā)現(xiàn)24小時(shí)之內(nèi)的基因表達(dá)差異不明顯。甚至于,人群差異大于儲(chǔ)存時(shí)間影響。然而,全血與PBMC的測序結(jié)果表明,大部分差異基因與紅細(xì)胞功能相關(guān),這很有可能是血紅蛋白的權(quán)重太大造成的背景干擾。
因此,全血試劑盒提取RNA替代傳統(tǒng)PBMC提取雖然操作簡便,但血紅蛋白基因相關(guān)的背景干擾影響了結(jié)果。
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