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大規(guī)模測序發(fā)現(xiàn)癌癥風險基因齊一生物

時間:2016/8/19閱讀:242
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近期發(fā)表在《Lancet Oncology》上的研究表明,一些已知癌基因發(fā)生生殖系突變可能增加個人對肉瘤的易感性,肉瘤是一種罕見的骨組織和軟組織癌癥。
作為肉瘤家族研究(ISKS)的一部分,澳大利亞研究人員領導的一個小組對1000多名肉瘤患者進行了靶向基因panel測序。除了已知的與肉瘤相關的基因突變外,測序數(shù)據(jù)還揭示出,與其他癌癥類型相關的基因,例如TP53、ERCC2、ATR、BRCA2和ATM,出現(xiàn)了復發(fā)性突變。
研究人員發(fā)現(xiàn),在這些接受檢測的患者中,超過一半的人攜帶有至少一個癌癥相關基因的突變,而且攜帶有多個癌癥相關基因的突變的患者發(fā)生早發(fā)性肉瘤的風險會增加,這類人占了檢測人群的1/5。
文章通訊作者、Kinghorn癌癥中心和Garvan醫(yī)學研究所癌癥部門主任DavidThomas說,“多種基因的影響相結合會增加肉瘤發(fā)生的風險,患者攜帶的突變越多,癌癥發(fā)生就越早。”
Thomas說,“以前我們無法判斷出這些具有患病風險的人群和家庭,但是現(xiàn)在我們可以更好地管理這種風險,并幫助這些人在需要的時候進行治療。”
Thomas和他的同事重點關注了72個潛在癌癥風險基因,對1162名15歲以上的肉瘤患者的血液或唾液樣本提取DNA,并進行靶向基因panel測序。約3/4的人是高加索人,其中約15%的人患有多原發(fā)性癌。
研究人員以來自三個大型研究(例如NHLBI的外顯子組計劃)的6500多名高加索人作為對照組發(fā)現(xiàn),約55%的肉瘤患者出現(xiàn)了可疑的生殖系變異增加的情況,這些變異似乎是致病性的。突變多發(fā)生在TP53、BRCA2、ATM、ATR和ERCC2基因中。
除了這些癌癥風險的線索之外,Thomas表示,“引起癌癥風險增高的這些遺傳變異還可幫助我們了解,如何采用的方式治療癌癥。在我們的研究對象中,1/3的患者攜帶的基因突變給了我們重要的信息,告訴我們?nèi)绾味ㄆ诒O(jiān)測這些患者以及他們是否應該接受某種治療。”
例如,28名肉瘤患者發(fā)生BRCA1或BRCA2生殖系突變,影響ru腺癌和卵巢癌風險。約20多名患者的ERCC2基因發(fā)生罕見的致病性突變,ERCC2基因編碼的蛋白通常有助于減少化療相關毒性。
該研究小組計劃繼續(xù)擴大當前研究結果,對具有肉瘤風險的人群的生殖系樣本進行全基因組測序,目前研究已經(jīng)啟動。
 
參考文獻:Monogenic and polygenic determinants of sarcoma risk: an international genetic study. DOI: 

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