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假定你抽提 rna 時(shí)使用到的有機(jī)試劑 - 氯仿、異丙醇、無水乙醇 - 都是國產(chǎn)的 (這是*可以使用的)。我的問題是:你采取了什么措施來降低或者杜絕 RNase 的污染?具體地:你是如何選擇、預(yù)處理、使用和保存氯仿和異丙醇? 你是如何配制和保存 75% 乙醇? 坦率地講,因?yàn)橛袡C(jī)試劑的問題導(dǎo)致抽提失敗,我真沒有聽到;或許有的問題是由有機(jī)試劑導(dǎo)致,但使用人也多是不會(huì)懷疑到這一點(diǎn)的??植婪肿拥男袨榈故锹牭竭^:對氯仿、75% 乙醇進(jìn)行高壓滅菌處理。令我無言的是,這樣的恐怖行為既沒有導(dǎo)致恐怖的后果,也沒有影響實(shí)驗(yàn)的成功。不過我還是想提供一些建議。我關(guān)注的是質(zhì)量控制,而不是單單是簡單或者方便。 RNA 抽提中涉及的有機(jī)試劑,包括*、氯仿、異丙醇、乙醇。*多為商品化的東西了,選擇和保存都不應(yīng)該有什么問題;只強(qiáng)調(diào)一點(diǎn):盡管 Tris 飽和的*也可以用于 RNA 的抽提,但使用水飽和*會(huì)更好一些,因?yàn)?RNA 在 pH 7 以上的溶液中,發(fā)生降解的機(jī)率大大提高。下面是關(guān)于氯仿、異丙醇、乙醇的有關(guān)建議。選擇國內(nèi)大的化學(xué)試劑公司生產(chǎn)或者監(jiān)制的分析純級別試劑就*可以滿足要求。預(yù)處理不需要進(jìn)行任何的預(yù)處理。不可以高溫高壓滅菌:這不是該不該的問題,而是能與不能的問題。這三個(gè)試劑的沸點(diǎn)都低于 100C,高溫高壓可能導(dǎo)致危險(xiǎn)。 75% 乙醇的配制一份無菌無酶的水與 3 份 (體積)無水乙醇混勻即成。不要使用量筒等過渡容器,使用天平來秤量:水的比重為 1,無水乙醇的比重按 0.785 計(jì)算。是先將無水乙醇倒出部分后再加入水,還是往裝水的瓶子中加入無水乙醇,沒有什么區(qū)別。事實(shí)上,70% - 80% 的乙醇都具有較好的洗滌能力,同時(shí)也不會(huì)導(dǎo)致片段比較大的核酸的丟失,所以,配制時(shí)就不要為了準(zhǔn)確而左勾右兌的。關(guān)于現(xiàn)用現(xiàn)配,從質(zhì)量控制角度看,不是一個(gè)好的辦法;這也是你永遠(yuǎn)發(fā)現(xiàn)不了75% 可能會(huì)有問題的基礎(chǔ)。75% 乙醇也不可以高溫高壓滅菌,原因同無水乙醇。保存首先,要使用新的試劑;試劑架上別人使用過并寫有標(biāo)記的,一定要找當(dāng)事人確定,以防已被用于其它用途而標(biāo)記未改。其次,分成相對小一點(diǎn)的包裝 (50ml – 100ml);500ml 的瓶子取液是非常不方便的,移液器的桿子往往都進(jìn)入了瓶口里,非常容易造成污染。第三,塑料瓶子密閉性好,裝醇類試劑是非常好的選擇;但氯仿不要使用塑料瓶子。第四,蓋緊瓶蓋,作好標(biāo)記,再在瓶子上蓋上一個(gè)透明塑料袋防塵。第五,保存于室溫。將有機(jī)試劑保存于冰箱的人不在少數(shù),但這么做卻是令人奇怪的。首先,任何揮發(fā)性的東西都不保存在冰箱 (除非萬不得已,如 DEPC),這應(yīng)該成為一個(gè)良好的習(xí)慣。其次,與外面相比,冰箱除了灰塵少一點(diǎn)外,什么都會(huì)比外面多的。第三,在室溫打開低溫的瓶子,將導(dǎo)致空氣大量進(jìn)入瓶子,增加了污染的風(fēng)險(xiǎn)。使用非常幸運(yùn)的是,有機(jī)試劑對菌污染和酶污染似乎有我們想象不到的抑制和滅活作用,所以,使用這些試劑沒有特殊的要求,按正常抽提 RNA 的要求就*可以了。吸取有機(jī)試劑時(shí),使用比要吸取的體積大的移液器,因?yàn)橛袡C(jī)試劑有越吸越多的現(xiàn)象,試劑容易接觸到移液器的桿頭 – 污染不說,氯仿會(huì)腐蝕桿頭的。75% 乙醇使用一次性的吸管移取,一次可以吸數(shù) ml,既快又方便。如果舍不得丟棄,用完后放入塑料自封袋中保存,是非常安全的。
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