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閱讀:323發(fā)布時間:2015-8-18
研究介紹了再生障礙性貧血的突變和克隆動態(tài)模式。這是由多種原因引起的造血障礙,有時會發(fā)展成骨髓增生異常綜合征或急性髓系白血病。
研究小組綜合利用外顯子組測序、靶向測序和基于芯片的核型分析,研究了400多名患者血液樣本的體細(xì)胞突變圖譜。通過這些數(shù)據(jù),研究人員在近一半的樣本中發(fā)現(xiàn)造血細(xì)胞克隆的擴(kuò)增。在約三分之一的病例中,他們檢測到與骨髓增生異常綜合征和/或AML相關(guān)的基因突變。
骨髓移植和免疫抑制療法已經(jīng)成功治療甚至*了許多再生障礙性貧血的病例。然而,大約有15%的患者仍然會發(fā)展成骨髓增生異常綜合征或急性髓系白血病,這個過程似乎涉及到某些含有突變的克隆的進(jìn)化和擴(kuò)增。此外,一些含有體細(xì)胞突變的造血干細(xì)胞克隆的擴(kuò)增也會導(dǎo)致其他疾病,如陣發(fā)性睡眠性血紅蛋白尿癥。
為了區(qū)分開這些不同疾病的克隆特征,研究人員利用測序來評估668個血液樣本中存在的突變,這些樣本來自439名再生障礙性貧血患者。研究人員對所有樣本開展靶向基因測序,重點關(guān)注106個之前與髓系腫瘤相關(guān)的基因,其平均覆蓋度達(dá)到1248倍。
利用測序的數(shù)據(jù),他們發(fā)現(xiàn)156名患者存在體細(xì)胞突變,其中56名患者攜帶兩個或更多的基因突變。超過四分之三的突變落入少數(shù)基因中,如BCOR、BCPRL1、PIGA、DNMT3A、和ASXL1。此外,超過10%病例的6號染色體出現(xiàn)小問題,與陣發(fā)性睡眠性血紅蛋白尿癥存在關(guān)聯(lián)。
之后,研究人員對52名患者的135個樣本進(jìn)行了外顯子組測序,平均覆蓋度達(dá)到112倍。他們在25個病例中發(fā)現(xiàn)了體細(xì)胞突變事件。
結(jié)果表明,再生障礙性貧血的發(fā)展往往伴隨著一些克隆的減少或維持,以及另一些克隆的擴(kuò)增。前者包括含有BCOR、BCORL1或PIGA突變的克隆,而后者的特點是含有DNMT3A和/或ASXL1突變。
DNMT3A、ASXL1和RUNX1中突變的存在與無進(jìn)展生存期和總生存時間較短相關(guān)。相比之下,BCOR和BCORL1的突變則對應(yīng)了免疫抑制療法的良好預(yù)后。
不過,研究人員也指出,克隆動態(tài)似乎變化很大,這讓預(yù)后難以判斷。此外,隨著年齡增長,血細(xì)胞逐漸積累突變,這似乎讓預(yù)測進(jìn)一步復(fù)雜化。“通過深度測序和SNP芯片核型分析密切監(jiān)控克隆,并結(jié)合臨床評估,才能判斷預(yù)后并指導(dǎo)治療,"他們總結(jié)道。
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