在分子生物學(xué)的中心法則中，遺傳信息從DNA、RNA流向蛋白。基因組DNA和組蛋白上都存在可逆的表觀遺傳學(xué)修飾，這些修飾可以調(diào)控基因的表達(dá)，并由此決定細(xì)胞的狀態(tài)，影響細(xì)胞的分化和發(fā)育。近年來人們發(fā)現(xiàn)，mRNA和其他RNA上也存在類似的調(diào)控機(jī)制。
N6-methyladenosine（m6A）是真核生物mRNA和長非編碼RNA上zui普遍的一種RNA修飾，介導(dǎo)了超過80%的RNA堿基甲基化。這種甲基化修飾非常普遍，出現(xiàn)頻率大約是3-5個殘基/mRNA。m6A甲基化是一個可逆的過程，具有重要的生物學(xué)功能。人們已經(jīng)陸續(xù)鑒定了m6A所需的“讀”、“寫”和“擦除”蛋白，但對其生物學(xué)功能還知之甚少。
YTHDF是m6A的讀取蛋白，YTHDF的結(jié)合會改變m6A RNA的翻譯效率和穩(wěn)定性。然而，人們還不了解YTHDF蛋白是如何造成m6A RNA降解的。研究團(tuán)隊八月二十五日在雜志上發(fā)表文章，揭示了YTHDF蛋白的作用機(jī)制。
研究顯示，YTHDF加快m6A RNA脫腺苷酸化的作用，是通過CCR4-NOT蛋白復(fù)合體實現(xiàn)的。YTHDF2的N端區(qū)域能與C亞基的SH結(jié)構(gòu)域直接互作，由此招募CCR4–NOT蛋白復(fù)合體。研究人員指出，這種招募是m6A RNA脫腺苷酸化所必需的。
目前的m6A分析方法主要是把methyl-RNA免疫沉淀和測序結(jié)合起來，稱為MeRIP-Seq或者m6A-Seq。這種方法只能將m6A殘基定位在100–200 nt的轉(zhuǎn)錄本區(qū)域中，無法在全轉(zhuǎn)錄組水平上鑒定m6A的位置。去年六月美國康奈爾大學(xué)的研究團(tuán)隊在雜志上發(fā)表了一種名為miCLIP的新技術(shù)。這種技術(shù)可以很方便的獲得單核苷酸分辨率m6A圖譜。
去年年底，研究團(tuán)隊通過全轉(zhuǎn)錄組高通量深度m6A測序，揭示了擬南芥不同器官之間差異性的m6A甲基化模式。這項研究顯示，擬南芥中超過三分之二的轉(zhuǎn)錄本存在m6A修飾，這些m6A主要分布在終止密碼子附近。高度甲基化的轉(zhuǎn)錄本主要涉及轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白、應(yīng)激反應(yīng)、氧化還原反應(yīng)、調(diào)控因子以及一些非編碼RNA。
近年來科學(xué)家們逐漸發(fā)現(xiàn)m6A修飾與人類疾病關(guān)系密切，但對m6A起到的具體作用還知之甚少。約翰霍普金斯大學(xué)和中山大學(xué)的研究人員發(fā)現(xiàn)，低氧條件通過m6A去甲基化誘導(dǎo)乳*癌干細(xì)胞表型。
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