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閱讀:366發(fā)布時(shí)間:2013-5-27
近日,復(fù)旦大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院青年教師熊成龍、張志杰等以*的生物信息學(xué)為手段,對(duì)本次H7N9禽流感病毒基因進(jìn)行研究和分析,找到了該病毒的起源和演化規(guī)律,發(fā)現(xiàn)該病毒的兩個(gè)zui重要蛋白HA和NA并非如此前中外學(xué)術(shù)界專家所認(rèn)為的“分別來(lái)源于中國(guó)和韓國(guó)禽類”,而是起源于中國(guó)華東地區(qū)的家禽或野鳥。
該成果對(duì)預(yù)防和溯源流感與禽流感有重要意義,相關(guān)論文已在線發(fā)表在美國(guó)《臨床感染病》雜志上。
今年2月起,我國(guó)華東地區(qū)陸續(xù)出現(xiàn)系列流感樣病例,對(duì)于該病毒的起源,中外學(xué)術(shù)界普遍認(rèn)為來(lái)自中韓禽類。他們的根據(jù)是:采集到的1株H7亞型HA(即H7N3病毒)來(lái)源于中國(guó)杭州的杭州鴨,而采集到的7株N9亞型NA(即H7N9病毒)則來(lái)源于韓國(guó)禽類。
該團(tuán)隊(duì)認(rèn)同中外學(xué)術(shù)界對(duì)HA來(lái)源的結(jié)論,但對(duì)NA來(lái)源則有異議。為此,研究人員分析了共享的流感數(shù)據(jù)庫(kù)。其中長(zhǎng)度大于1000核苷酸的N9基因序列共321個(gè)NA序列,并由此推導(dǎo)出相應(yīng)的蛋白質(zhì)氨基酸序列,zui終證實(shí),H7N9禽流感病毒的zui重要蛋白HA(N9基因)來(lái)源于中國(guó)江蘇洪澤湖花臉鴨。
研究人員認(rèn)為“zui重要的依據(jù)”是,從基因的核苷酸和蛋白質(zhì)氨基酸序列相似性搜索結(jié)果來(lái)看,H7N9病毒的zui重要蛋白NA與H11N9病毒在核苷酸和氨基酸層次上序列的相似性分別是96.2%和96.8%;而7株韓國(guó)株NA亞型株相似性分別為93.3%至95.5%和87.9%至96.4%。前者遠(yuǎn)高于后者。
研究人員還認(rèn)為,杭州是H7N3病毒的分離地,也是本次流感流行的主要疫區(qū)之一,洪澤湖區(qū)也是H11N9病毒的分離地。也就是說(shuō),從本次流感zui初發(fā)生地、H7亞型HA貢獻(xiàn)株分離地以及H11N9病毒分離地點(diǎn)來(lái)看,均位于中國(guó)的華東地區(qū),從地理位置上來(lái)看,病毒株發(fā)生重組的可能性也遠(yuǎn)高于韓國(guó)株。
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