DGGE變性梯度凝膠電泳系統(tǒng)為我公司產(chǎn)品(三項(xiàng)),該系統(tǒng)包括內(nèi)置式溫度控制系統(tǒng)、中文可編程控電源、梯度凝膠生成器、內(nèi)置式緩沖液循環(huán)泵及攪拌槳、電泳槽、梯度生成器、制膠配件及玻璃板等。該產(chǎn)品自上市以來深受廣大用戶的一直好評,使用單位包括中科院地理與湖泊研究所、中科院地球與化學(xué)研究所、中國農(nóng)科院花卉與蔬菜研究所、、東北農(nóng)業(yè)大學(xué)、江蘇省農(nóng)科院、三峽大學(xué)、江漢大學(xué)、中國地質(zhì)大學(xué)、揚(yáng)州大學(xué)、江蘇科技大學(xué)、華東師范大學(xué)、延邊大學(xué)等。
DGGE介紹:
變性梯度凝膠電泳法(denaturinggradient gel electrophoresis,DGGE)分析PCR產(chǎn)物,如果突變發(fā)生在解鏈的DNA區(qū)域,檢出率可達(dá)100%,檢測片段可達(dá)1kb,圍為100bp-500bp?;驹砘诋?dāng)雙鏈DNA在變性梯度凝膠中進(jìn)行到與DNA變性溫度一致的凝膠位置時,DNA發(fā)生部分解鏈,電泳遷移率下降,當(dāng)解鏈的DNA鏈中有一個堿基改變時,會在不同的時間發(fā)生解鏈,因影響電泳速度變化的程度而被分離。由于變性梯度凝膠電泳法是利用溫度和梯度凝膠遷移率來檢測,需要一套專用的電泳裝置,合成的PCR引物在5`末端加一段40bp-50bp的GC夾,以利于檢測發(fā)生于高熔點(diǎn)區(qū)的突變。
DGGE原理:
變性梯度凝膠電泳系統(tǒng)(denaturinggradient gel electrophoresis, DGGE)的原理是使用一對特異性引物,PCR擴(kuò)增微生物自然群體的16s rRNA基因,產(chǎn)生長度相同但序列有異的DNA片段的混合物。然后用變性梯度凝膠電泳分離產(chǎn)物混合物。變性梯度凝膠電泳DGGE膠是在6%聚丙烯酰胺膠中添加線性梯度的變性劑,變性劑的濃度由上到下,從低到高成線性梯度。在一定溫度下,在同一濃度的變性劑濃度下,序列不同的產(chǎn)物,其部分解鏈程度也不同,而產(chǎn)物解鏈程度又直接影響其電泳遷移率,結(jié)果不同的產(chǎn)物在凝膠上分離開來。在引物的5’端加上40個堿基左右的G-C串可使變性梯度凝膠電泳DGGE對序列差異的分辨率提高到近100%。所以變性梯度凝膠電泳法可用于微生物群落結(jié)構(gòu)的研究、微生物種群動態(tài)的分析、富集培養(yǎng)物及分離物的分析、核糖體RNA同源性的分析。但由于在PCR擴(kuò)增過程中可能存在堿基插入的錯誤、不同微生物細(xì)胞破壁難易的不同等而造成分析結(jié)果的偏差。
DGGE應(yīng)用領(lǐng)域:
DGGE變性梯度凝膠電泳系統(tǒng)主要應(yīng)用于環(huán)境樣品細(xì)菌、古細(xì)菌、真菌、真核微生物的多樣性分析(土壤、水等樣品無需培養(yǎng),直接提取DNA擴(kuò)增檢測)動、植物體內(nèi)外共生微生物的檢測;食品微生物的檢測;醫(yī)學(xué)領(lǐng)域堿基突變的檢測,雜合子檢測等等。
DGGE的特點(diǎn):
DGGE凝膠具有變性劑濃度梯度,可以根據(jù)DNA片段的退火溫度分辨不同片段,分辨率可達(dá)到一個堿基。
DGGE具有精密控溫系統(tǒng),比一般聚丙烯酰胺凝膠電泳具有更高的可重復(fù)性。
DGGE可以對環(huán)境樣品DNA的PCR產(chǎn)物進(jìn)行分離進(jìn)而克隆測序,比一般聚丙烯酰胺凝膠電泳僅僅根據(jù)片段長短進(jìn)行分離前進(jìn)了一大步。
幾乎可以檢出所有突變,無須對引物標(biāo)記。
可將突變分子完好無損地同野生型分子分開用于進(jìn)一步的分析。
可檢測流感病毒基因多樣性,遺傳圖譜分析,單核苷酸差異SNP檢測。
可檢測出象甲基化之類的DNA修飾。
DGGE實(shí)驗(yàn)流程:
DNA樣品的提取→ PCR擴(kuò)增→ DGGE電泳→ 帶型分析→ 特征條帶的測序
DGGE技術(shù)指標(biāo):
兩段程控,每段最長時間24小時,控制精度1秒
電壓范圍0-200V,精度0.1%,電流范圍0-150mA,紋波系數(shù)0.1%
微電腦智能控制,中文液晶顯示,具有過壓、過流、過載和報警等裝置
鉑金電極插座裹覆于安全覆蓋內(nèi),避免意外觸及,降低緩沖區(qū)因高溫蒸發(fā)
緩沖式槽體以玻璃材質(zhì)制成,于電泳作業(yè)時,不因高溫變形
完善的加熱,攪拌,緩沖檢測組件設(shè)計,使溫度分布均勻達(dá)±0.2oC
其中緩沖檢測設(shè)計無需額外的蠕動泵,使緩沖區(qū)循環(huán)效果達(dá)狀態(tài)
高精度和高可靠性,可對單堿基突變進(jìn)行檢測
DGGE規(guī)格型號:
DGGE1102變性梯度凝膠電泳系統(tǒng)(denaturinggradient gel electrophoresis,DGGE1102)
DGGE1104變性梯度凝膠電泳系統(tǒng)(denaturinggradient gel electrophoresis,DGGE1104)