ABI 3500基因測序儀的詳細(xì)介紹
Applied Biosystems公司的8道毛細(xì)管3500基因分析儀和24道毛細(xì)管3500xL基因分析儀為毛細(xì)管電泳建立了新的標(biāo)準(zhǔn)。3500系列基因分析儀為支持驗證和法規(guī)規(guī)范環(huán)境中對儀器性能的嚴(yán)格要求而設(shè)計，同時保留了生命科學(xué)研究人員心目中Applied Biosystems產(chǎn)品一貫擁有的的應(yīng)用多功能性.性能特點(diǎn)
- 8道毛細(xì)管3500系統(tǒng)和24道毛細(xì)管3500xL系統(tǒng)，可升級。
- *的導(dǎo)熱系統(tǒng)設(shè)計，更好滿足DNA片段分析時對溫度控制的嚴(yán)格要求。
- 505 nm單波長固態(tài)長壽激光源——采用標(biāo)準(zhǔn)電源供電，無需散熱
- 不同儀器之間不同運(yùn)行之間以及不同毛細(xì)管之間的信號強(qiáng)度一致性得到顯著改善
- 強(qiáng)大、綜合的數(shù)據(jù)采集和初步分析軟件，提供了數(shù)據(jù)質(zhì)量的實時評估
- 無線射頻識別（RFID）技術(shù)追蹤關(guān)鍵消耗品數(shù)據(jù)并記錄管理信息
- *的多色熒光分析能力，可對DNA片段進(jìn)行多達(dá)6種不同熒光染料的多重檢測
- 的應(yīng)用靈活性—一種毛細(xì)管陣列、一種聚合物分離膠，通用于大部分研究應(yīng)用
- 簡單的安裝、操作和維護(hù)——迄今為止最容易擁有、運(yùn)行的DNA測序儀
3500系列可與你的工作環(huán)境無縫整合，確保了易用性，而又不失可靠性。提供即用型的上樣即可運(yùn)行的消耗品，可縮短手工操作時間。預(yù)先配制好的基本消耗品避免了混合或操作誤差的可能性，在清空之后陽極和陰極緩沖液槽還可回收以循環(huán)再生。
高分子聚合物袋、陰極和陽極緩沖液槽、易于安裝的毛細(xì)管陣列都在產(chǎn)品標(biāo)簽上包含了完整的無線電頻率識別（RFID）標(biāo)簽。這些*的裝置能讓3500系列的數(shù)據(jù)采集軟件對試劑和消耗品的關(guān)鍵信息進(jìn)行瀏覽、跟蹤和報告，其中包括用量、批號、貨號、保質(zhì)期和儀器上的使用期限。在追蹤系統(tǒng)表現(xiàn)時，這些特征能幫助簡化關(guān)鍵的日常管理工作，省時省力。這個強(qiáng)有力的工具能將你的想法與實驗結(jié)果之間的屏障最小化。
簡單如同駕駛
3500 系列數(shù)據(jù)采集軟件的用戶友好導(dǎo)航采用直觀的儀表盤設(shè)計、顯而易見的常規(guī)操作按鈕、易讀取的圖表顯示。通過即時讀取堿基或片段大小的數(shù)據(jù)，科學(xué)家們可以在數(shù)據(jù)產(chǎn)生時即判斷它們的質(zhì)量，而無需將輸出文件轉(zhuǎn)移到二級分析軟件包。系統(tǒng)還提供了預(yù)配置的樣品反應(yīng)板設(shè)置，來進(jìn)一步支持快速有效的測序和片段分析的運(yùn)行設(shè)置
DNA 測序
3500系列與Applied Biosystems BigDye® 循環(huán)測序試劑盒共同使用，更將超越預(yù)期，提供的自動化、性能表現(xiàn)、數(shù)據(jù)質(zhì)量檢查以及簡易操作。3500系列可在最少的用戶干預(yù)下實現(xiàn)不同研究應(yīng)用間的輕松轉(zhuǎn)換。此外，3500系列設(shè)計了特別方案，針對用BigDye xTerminator純化試劑盒所制備的樣品，可進(jìn)一步提升序列質(zhì)量。
片段分析
可同時檢測多達(dá)6 種熒光染料的設(shè)計，使得3500 系列可實現(xiàn)更高水平的多重片段分析應(yīng)用，每輪運(yùn)行中提供更高的通量水平和更多的數(shù)據(jù)點(diǎn)，同時也減低了每個樣品的平均費(fèi)用。
將一切整合
3500平臺能運(yùn)行多種類型的應(yīng)用――包括新基因測序和重測序（突變圖譜）以及微衛(wèi)星分析、MLPA、LOH、AFLP、MLST，及SNP的驗證和篩選。大部分應(yīng)用能在一種膠和毛細(xì)管陣列上運(yùn)行，3500系列數(shù)據(jù)采集軟件可與多種Applied Biosystems下游軟件包無縫整合，從而提供了基因數(shù)據(jù)的綜合分析：
- Variant Reporter™軟件――用于突變檢測和分析，SNP探查和驗證，以及序列確認(rèn)
- 測序分析軟件――用于測序數(shù)據(jù)的分析、顯示、編輯、保存和打印
- SeqScape軟件――用于突變檢測和基于樣品庫的等位基因鑒定
- GeneMapper軟件――基因分型、等位基因判定、片段分析和SNP分析的理想工具
Applied Biosystems 3500系列基因分析儀是我們?nèi)嫱暾臏y序及片段分析應(yīng)用系統(tǒng)中的組成部分，系統(tǒng)綜合了優(yōu)化的DNA分離試劑，包括特定的應(yīng)用試劑盒和各種基因研究的工作流程，以及數(shù)據(jù)分析和瀏覽的工具。3500系列是目前大的基因分析工具。而且，8泳道毛細(xì)管的3500可相當(dāng)容易地升級到24 泳道毛細(xì)管的3500xL，讓儀器伴隨你的實驗進(jìn)展而擴(kuò)展.
系統(tǒng)組件
- 毛細(xì)管電泳儀
- 8道毛細(xì)管（3500系統(tǒng)）或24道毛細(xì)管（3500xL系統(tǒng)）毛細(xì)管陣列及高分子分離膠
- DNA測序和/或片段分析系統(tǒng)專用的試劑及耗材
- Dell計算機(jī)工作站及液晶顯示器
- 整合的軟件，用于儀器控制、數(shù)據(jù)采集、質(zhì)量控制，及用于堿基檢出和片段篩分的樣品文件自動分析
性能指標(biāo)
| 性能 | |||||||
| 總體 | 90%樣品中99%等位基因的篩分精確度 | 90%樣品中99%等位基因的多道篩分 | |||||
| 90%以上樣品中的分辨率范圍 | 90%以上樣品中收集到的片斷 | 50–400bp | 401–600 bp | 601–1,200 bp | 50–400 bp | 401–600 bp | 601–1,200 bp |
| ≤40 to≥520 | ≥600 | <0.15 | <0.30 | NA | <1 bp | <2 bp | NA |
| ≤20 to≥550 | ≥600 | <0.15 | <0.30 | NA | <1 bp | <2 bp | NA |
| ≤40 to≥700 | ≥1200 | <0.15 | <0.30 | <0.45 | <1 bp | <2 bp | <3 bp |
| ≤60 to≥400 | ≥420 | <0.15 | NA | NA | <1 bp | NA | NA |
| ≤60 to≥400 | ≥420 | <0.15 | NA | NA | <1 bp | NA | NA |
| ≤40 to≥120 | ≥120 | <0.50 | NA | NA | <1 bp | NA | NA |
運(yùn)行參數(shù)
| 激光 | 長壽命、單道505nm，固態(tài)激光激發(fā)源 |
| 電泳電壓 | 高達(dá)20 kV |
| 溫控箱溫度 | 動態(tài)溫度控制 從18°C到70°C |
| 計算機(jī)要求 | 硬件：奔騰IV 1.86 GHz處理器 操作系統(tǒng)：Windows® Vista SP1 內(nèi)存：2 GB 硬盤：1X 80 GB 7200 RPM SATA 3.0GB/s及 8 MB數(shù)據(jù)高速緩存 |
| 操作環(huán)境 | 溫度：15-30°C （在儀器運(yùn)行時室溫的波動不能超過±2°C） 濕度：20-80%（不凝結(jié)） |
| 主要電源電壓 | 100-240 V±10% 50-60 Hz±10% |
| 電流 | 值：15 A |
| 功率消耗 | 417 VA、371 W（近似值，不包括計算機(jī)和顯示器） |
| 尺寸 | 寬度（門關(guān)閉）：61 cm 寬度（門打開）：122 cm 深度：61 cm 高度：72 cm 重量：82 kg（近似值） |
