RNAfixer 無液氮 RNA 樣品儲存液
貨號 | 規(guī)格 | 分類 |
XG-P2721 | 100ml | 核酸純化 |
保存條件:
室溫(18-25℃)保存1 年以上,如果使用時發(fā)現(xiàn)有沉淀或者析出,可以37℃水浴加熱重新溶解后使用,重新溶解后不會影響產品質量。
產品介紹:
RNAfixer 是一種液態(tài)的無毒的組織保存液體,可以迅速滲入新鮮組織細胞的胞漿中,在非凍狀態(tài)下原位穩(wěn)定和保護細胞內的RNA。取下組織薄片后立刻浸入RNAfixer 保存并不影響將來提取RNA 的質量和數(shù)量。RNAfixer 消除了RNA 樣品需要立刻處理或者必須液氮保存的不方便。浸入RNAfixer 后,新鮮組織細胞中RNA 可以完好的在37℃下保存一天,在25℃下保存一周,4℃下保存一個月,在-20℃或-80℃下長期保存。
RNA 病毒樣品(如HCV 和HIV)可在37℃保存一個月。適用于動物組織(心、肝、腎、肌肉、睪丸、腦、脾等)、培養(yǎng)細胞、RNA 病毒、 果蠅、細菌、白細胞、一些植物組織等。
產品特點:
1.操作容易:將組織成適當大小,浸沒在RNAfixer 中即可使其RNA 不被降解。
2.無需液氮:使樣品的保存不需液氮,干冰或-80℃冰箱,尤其適用于臨床和野外樣品的快速和大規(guī)模采集。
3.方便運輸:處理過的樣品能在25℃保存一周,使樣品郵寄和運輸變得容易和便宜,有利學術合作和交流。
4.多次凍融: 經RNAfixer 處理的樣品可反復凍融多次, 其間可對樣品進行各種處理而不影響最終提取的RNA 的質量。
5.可比性強: RNAfixer 能減少大規(guī)模樣品處理中的誤差,增加各次實驗數(shù)間的可比性, 對大規(guī)模基因表達譜的分析尤其有用。
使用說明:
RNAfixer 只用于新鮮組織,浸泡入 RNAfixer 前禁止冷凍組織。只需要迅速將新鮮組織成長、寬,高任意一邊厚度<0.5 厘米浸泡入 RNAfixer 即可(只要有一邊厚度不超過 0.5 厘米,RNAfixer 可以迅速滲透,其它兩邊的尺寸并不重要)。將新鮮組織浸泡 在 5 倍體積的 RNAfixer 中,按照指示存放在適當?shù)臏囟取?/span>
1.動物組織 RNAfixer 并不破壞或者溶解組織結構,因此浸泡在 RNAfixer 中達到滲透平衡的組織 可以從 RNAfixer 中取出,然后切成更小的塊,然后放回到 RNAfixer 中下次繼續(xù)使用。小器官如小鼠肝、腎、脾不需要剪切,可以完整的存放在 RNAfixer 中。
推薦不同組織樣品的 RNAstore 使用量:
2.植物組織很多植物組織直接浸泡入 RNAfixer 即可,有的植物有天然滲透屏障如臘質保護層,需要先破壞掉臘質層,便于 RNAfixer 滲透。
3.組織培養(yǎng)細胞細胞吹打下來后,離心收集細胞,棄上清,用冰浴的 PBS 緩沖液洗一次去除殘留培養(yǎng)液。將細胞懸浮在少量 PBS 緩沖液中。加入五到十倍體積 RNAfixer, 混均。
4.白細胞對于全血中白細胞的保存,需將白細胞從紅細胞和血清中分離出來,并按組織培養(yǎng)細胞一樣處理后,白細胞便能有效地保存在 RNAfixer 中。不要將全血、血漿或血清中的 RNA 保存在 RNAfixer 中,因為它們蛋白含量過高,與 RNAfixer 混合后易形成不溶的沉淀。
5.細菌
細菌并不能在 RNAfixer 中生長,但是 RNAfixer 并不破壞細菌,E. coli 在 4℃保存一個月仍舊可以提出完整的 RNA。
RNAfixer 中樣本的存放:
1.存放在-80℃樣品長期保存用。將 RNA fixer 中樣本放置于 4℃過夜,然后將樣本撈出,盡量去除干凈 RNAfixer 液體,然后放置于-80℃。對于組織培養(yǎng)細胞,則不需要去除RNAfixer,直接冷凍于-80℃,并不會裂解細胞。樣品使用時可以在室溫融化,并且還可以再次冷凍而不影響 RNA 的完整性和產量。
2.存放在-20℃將 RNAfixer 中樣本放置于 4℃過夜,然后轉移到-20℃。在-20℃樣品并不會被冰凍,但是可能會形成一些結晶,這并不會影響將來的 RNA 提取。樣品使用時可以在室溫 融化,并且還可以再次冷凍而不影響 RNA 的完整性和產量。
3.存放在 4℃樣本可以在 4℃存放一個月。
4.存放于 25℃存放于 25℃樣本的 RNA 在一周內保持完整,保存兩周的樣品 RNA 有輕微降解,勉強能用于northern analysis, 但是質量足夠用于nuclease protection assay or RT-PCR 。
5.存放于 37℃存放于 37℃樣本的 RNA 在 24 小時內保持完整,3 天的時候有部分降解。RNAfixer 保存樣本的 RNA 提?。?/span>將樣本從 RNAfixer 中取出,RNAfixer 可以直接倒入水池,用自來水沖即可,不需特殊處理。
1.組織
用干凈鑷子將樣本從 RNAfixer 中撈出,用吸水紙稍稍吸去殘留的 RNAfixer 后,可以和新鮮組織一樣按照液氮研磨,然后勻漿處理的標準程序進行提取 RNA。
2.細胞
對于儲存在 RNAfixer 中的細胞有兩種選擇。一是去除 RNAfixer 后提取 RNA, 另一個是直接從細胞和 RNAfixer 的混合物提取。
1)去除 RNAfixer 后提取 RNA存放于 RNAfixer 中的細胞變得不那么脆弱,可以承受較高的離心速度而不被裂解。 我們有在 5000g 離心成功收集細胞的經驗,由于每種細胞的強度不一樣,可以先用不重要的細胞做個預試驗,以保證在使用的速度下離心不會破壞細胞。另一個選擇是在離心前加等體積的 PBS 稀釋 RNAfixer 和細胞的混合物,以減少溶液的密度,使細胞溶液可以沉淀下來。
2)不去除 RNAfixer,直接提取 RNA
也可以直接加 10 倍體積的一步法提取試劑(如 TRIpure,TRI reagent)到細胞和RNAfixer 的混合物,然后按照正常步驟操作。
一、模板DNA:PCR反應需要模板DNA,如從細胞、組織、血液中提取DNA等;
二、引物:PCR反應的兩個引物,分別與模板DNA的兩端配對擴增所需的特定區(qū)域,引物也可以合成為TA克隆等過程中使用到的引物;
三、dNTPs:PCR反應中需要四種dNTPs,包括脫氧腺苷酸(dATP)、脫氧胸苷酸(dCTP)、脫氧鳥苷酸(dGTP)、脫氧胞嘧啶酸(dTTP),用于細胞分裂、DNA合成 等生物學過程,用于PCR擴增的模板DNA鏈的延伸和擴增;
四、Taq DNA聚合酶:PCR反應需要的聚合酶,一般使用Taq聚合酶,還有一些其他種類的聚合酶如PFU、Phusion等,用于擴增DNA鏈;
五、PCR buffer溶液:對PCR反應具有緩沖作用,調節(jié)反應pH,硫代硫酸氫鹽SDS、小分子有機化合物如甲醛,可增強PCR反應特異性,從而提高反應效率;
六、酶切體系:PCR擴增往往涉及到重組、構建和測序等等實驗步驟,常常需要進行酶切操作。
七、MARK:一種分子量標準,用來判別DNA片段大小的工具。
八、DNA純化試劑盒:用于純化PCR反應產物;
①Oligo dT
選擇Oligo dT時,要求RNA必須有Poly A,所以真核生物的mRNA都適用。適合長鏈甚至全長mRNA的RT,對RNA樣品的質量要求較高,不要有明顯的DNA污染、RNA降解和RNA斷裂。假如想探索新的mRNA進行RT反應,建議推薦使用Oligo dT引物。使用Oligo dT引物要比隨機引物和特異性引物的穩(wěn)定性要好。
②隨機引物
適合各種RNA的RT,尤其適合模板豐度很低的情況(比如某個gene表達量很低)。選擇隨機引物時,鏈cDNA合成反應中就是以所有的RNA為模板,然后進行PCR反應時設計引物進行特異性擴增。同時要注意隨機引物的量和總RNA量之間的關系,一般建議每5µg總RNA的隨機引物的用量為50ng,如果每5µg總RNA的隨機引物的用量超過250ng,可能會導致小片段產物(<500bp)的增加和長片段、全長產物的降低。
③特異性引物
基因特異性引物(GSP)是某個基因序列的一部分,與模板互補的引物。該引物需要結合目標RNA的已知序列進行設計。由于引物和RNA序列特異性結合,每個目標RNA都需要一套新的基因特異性引物。因此,當分析多種目標時,則需要適用更多的RNA樣本。而且不同引物退火溫度本來就不相同,所以一般不推薦使用。如需要使用特異性引物,建議對退火溫度進行優(yōu)化。
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